28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6567 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 1101 aa  2104    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  31.24 
 
 		 1129 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 1169 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 963 aa  83.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1333  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 		 1074 aa  79.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  25.39 
 
 		 972 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0954  protein of unknown function DUF214  35.1 
 
 		 1090 aa  67.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0173723  normal  0.0708717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  25.84 
 
 		 947 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  25.6 
 
 		 973 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  33.87 
 
 		 1081 aa  63.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  25.96 
 
 		 948 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  22.85 
 
 		 953 aa  57.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 		 831 aa  57.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  24.7 
 
 		 968 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  23.94 
 
 		 968 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.32 
 
 		 394 aa  52  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0958  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 		 1119 aa  48.5  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.502077  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  21.18 
 
 		 643 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  21.18 
 
 		 643 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  21.18 
 
 		 641 aa  47.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  32.18 
 
 		 387 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  22.81 
 
 		 644 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  32.52 
 
 		 412 aa  46.2  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 852 aa  45.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  20.59 
 
 		 643 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2428  permease  20.59 
 
 		 428 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0996283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  38.98 
 
 		 419 aa  45.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  24.11 
 
 		 856 aa  45.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>