47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1203 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  44.11 
 
 		 953 aa  792    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  47.13 
 
 		 973 aa  743    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  42.38 
 
 		 963 aa  664    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  90.81 
 
 		 968 aa  1641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 968 aa  1882    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  46.89 
 
 		 972 aa  746    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  35.77 
 
 		 947 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  35.8 
 
 		 948 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  44.44 
 
 		 842 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1383  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1026 aa  53.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.980355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  30.19 
 
 		 858 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0958  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 1119 aa  52.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.502077  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 1081 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  43.21 
 
 		 842 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 		 846 aa  52  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  43.21 
 
 		 842 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.36 
 
 		 870 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 852 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.44 
 
 		 842 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  29.44 
 
 		 858 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  29.35 
 
 		 845 aa  49.3  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1605  hypothetical protein  25.56 
 
 		 897 aa  49.7  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.453763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  35 
 
 		 834 aa  49.3  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 1129 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  47.22 
 
 		 859 aa  48.9  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  40.19 
 
 		 878 aa  48.9  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 838 aa  48.5  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  24.15 
 
 		 410 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.97 
 
 		 880 aa  47.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.04 
 
 		 414 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  23.5 
 
 		 415 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 		 400 aa  46.6  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.59 
 
 		 414 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 1101 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 848 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  40.79 
 
 		 857 aa  45.8  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  36.84 
 
 		 841 aa  45.8  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  35.64 
 
 		 846 aa  45.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.39 
 
 		 397 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.7 
 
 		 843 aa  45.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.49 
 
 		 371 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 		 847 aa  45.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.45 
 
 		 381 aa  45.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 		 1169 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  37.18 
 
 		 855 aa  44.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25 
 
 		 702 aa  44.7  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 856 aa  44.3  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>