34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1605 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1605  hypothetical protein  100 
 
 		 897 aa  1749    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.453763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  28.07 
 
 		 963 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  26.07 
 
 		 973 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  25.36 
 
 		 972 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  24.54 
 
 		 968 aa  54.3  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  29.53 
 
 		 877 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  20.11 
 
 		 386 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  25.09 
 
 		 968 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 953 aa  50.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.93 
 
 		 397 aa  51.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  27.5 
 
 		 414 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.78 
 
 		 863 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.76 
 
 		 854 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  18.54 
 
 		 829 aa  48.5  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  18.54 
 
 		 829 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.61 
 
 		 817 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  22.83 
 
 		 381 aa  48.5  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  27.14 
 
 		 433 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 848 aa  48.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  18.75 
 
 		 387 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.7 
 
 		 411 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  21.33 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  28.02 
 
 		 845 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.36 
 
 		 843 aa  45.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.33 
 
 		 838 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  29.37 
 
 		 414 aa  45.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.37 
 
 		 414 aa  45.4  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 		 787 aa  45.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  30.73 
 
 		 833 aa  45.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 797 aa  45.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  28.12 
 
 		 846 aa  45.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.31 
 
 		 841 aa  45.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  21.99 
 
 		 390 aa  44.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.76 
 
 		 871 aa  44.3  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>