43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4356 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  100 
 
 		 973 aa  1930    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  47.66 
 
 		 968 aa  737    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  41.44 
 
 		 953 aa  700    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  46.99 
 
 		 963 aa  809    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  91.26 
 
 		 972 aa  1729    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  47.13 
 
 		 968 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  38.41 
 
 		 947 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  39.26 
 
 		 948 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1605  hypothetical protein  26.02 
 
 		 897 aa  55.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.453763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 1081 aa  54.3  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 1101 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 1169 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  29.03 
 
 		 395 aa  53.5  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 855 aa  52.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  22.85 
 
 		 835 aa  51.6  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1558  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 1090 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.04 
 
 		 854 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 		 846 aa  49.3  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 1129 aa  48.5  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  23.52 
 
 		 870 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 		 408 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0958  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 		 1119 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.502077  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.26 
 
 		 408 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  27.78 
 
 		 416 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  23.16 
 
 		 410 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.26 
 
 		 420 aa  47  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 873 aa  46.2  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.31 
 
 		 411 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 855 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.04 
 
 		 415 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  30.19 
 
 		 362 aa  45.8  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 		 878 aa  45.8  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 842 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  31.48 
 
 		 848 aa  45.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 842 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.28 
 
 		 436 aa  45.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  31.58 
 
 		 408 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  31.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.3 
 
 		 423 aa  45.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  27.78 
 
 		 416 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1383  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1026 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.980355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>