66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0178 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 972 aa  1931    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  46.94 
 
 		 968 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  41.52 
 
 		 953 aa  704    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  47.51 
 
 		 968 aa  739    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  47.13 
 
 		 963 aa  811    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  91.26 
 
 		 973 aa  1726    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  38.13 
 
 		 947 aa  562  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  39.08 
 
 		 948 aa  557  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 		 855 aa  67.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.73 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 835 aa  58.9  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  29.84 
 
 		 395 aa  55.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.31 
 
 		 854 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 1169 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.87 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.55 
 
 		 408 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1605  hypothetical protein  25.28 
 
 		 897 aa  52.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.453763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  37.93 
 
 		 408 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 1129 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  33.86 
 
 		 846 aa  50.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  33.12 
 
 		 408 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 		 411 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1557  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 923 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.63 
 
 		 411 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.56 
 
 		 417 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  30.41 
 
 		 862 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 		 1081 aa  49.7  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 1101 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 410 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  30.16 
 
 		 416 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 		 848 aa  48.5  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.76 
 
 		 855 aa  48.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 		 413 aa  48.1  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.12 
 
 		 423 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0958  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 1119 aa  47.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.502077  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  33.02 
 
 		 362 aa  47.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.32 
 
 		 423 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.97 
 
 		 415 aa  47.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.27 
 
 		 416 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1558  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 		 1090 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  30.16 
 
 		 416 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  31.33 
 
 		 926 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 852 aa  46.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 		 863 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  29.79 
 
 		 425 aa  46.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  22 
 
 		 853 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  23.21 
 
 		 410 aa  46.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.89 
 
 		 420 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 		 873 aa  45.8  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.71 
 
 		 409 aa  45.8  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  45.8  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 		 790 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  40.54 
 
 		 408 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  39.19 
 
 		 404 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.46 
 
 		 416 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2783  hypothetical protein  35.35 
 
 		 375 aa  45.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.753762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  25.79 
 
 		 850 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1418  protein of unknown function DUF214  21.89 
 
 		 730 aa  45.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.354153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.35 
 
 		 416 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  25.79 
 
 		 794 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  31.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1333  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 1074 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.16 
 
 		 415 aa  44.7  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  21.98 
 
 		 779 aa  44.3  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>