17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1557 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1557  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 923 aa  1716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26120  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  34.67 
 
 		 894 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4170  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 		 1030 aa  74.7  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134814  normal  0.186117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6566  protein of unknown function DUF214  31.89 
 
 		 940 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2805  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 		 966 aa  69.7  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.480341  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0790  hypothetical protein  40.79 
 
 		 766 aa  59.3  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  24.92 
 
 		 401 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0957  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 934 aa  55.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285055  hitchhiker  0.00243586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.72 
 
 		 843 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1333  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 		 1074 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0953  protein of unknown function DUF214  39.18 
 
 		 930 aa  52.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144444  normal  0.0504476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.57 
 
 		 842 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 963 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  24.94 
 
 		 947 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  21.28 
 
 		 972 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  31.58 
 
 		 414 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0954  protein of unknown function DUF214  31.6 
 
 		 1090 aa  44.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0173723  normal  0.0708717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>