28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2317 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  100 
 
 		 947 aa  1840    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  82.07 
 
 		 948 aa  1449    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  38.13 
 
 		 972 aa  555  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  38.41 
 
 		 973 aa  548  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  35.08 
 
 		 953 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  35.92 
 
 		 963 aa  532  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  35.69 
 
 		 968 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  35.66 
 
 		 968 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.43 
 
 		 402 aa  52.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  19.94 
 
 		 414 aa  52  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  19.94 
 
 		 414 aa  52  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.61 
 
 		 845 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 848 aa  49.3  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 1129 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.77 
 
 		 854 aa  48.5  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 786 aa  48.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  23.55 
 
 		 793 aa  47.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.82 
 
 		 393 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 376 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 		 930 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 		 838 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.55 
 
 		 424 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  30.48 
 
 		 410 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  24.9 
 
 		 435 aa  45.8  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 1101 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 635 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.73 
 
 		 426 aa  45.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  25.34 
 
 		 422 aa  45.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>