182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1655 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1526    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  43.76 
 
 		 780 aa  562  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  42.05 
 
 		 809 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  40.76 
 
 		 805 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  37.58 
 
 		 775 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  36.65 
 
 		 779 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.13 
 
 		 759 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.17 
 
 		 849 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  32.29 
 
 		 756 aa  62.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.21 
 
 		 851 aa  62.4  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.12 
 
 		 863 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.9 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 845 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.29 
 
 		 397 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  30.46 
 
 		 870 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  28.36 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  34.18 
 
 		 407 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 874 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.68 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  21.43 
 
 		 402 aa  56.6  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  25.84 
 
 		 657 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  32.73 
 
 		 847 aa  55.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  29.41 
 
 		 866 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.36 
 
 		 397 aa  55.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  23.85 
 
 		 397 aa  54.7  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.18 
 
 		 419 aa  54.3  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 419 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 452 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.81 
 
 		 843 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 849 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  27.34 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  31.34 
 
 		 408 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 873 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 		 849 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.62 
 
 		 850 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  21.75 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.25 
 
 		 419 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.33 
 
 		 857 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 		 855 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 		 405 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 		 408 aa  52  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.31 
 
 		 414 aa  52.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  41.89 
 
 		 827 aa  52  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.72 
 
 		 397 aa  52.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.38 
 
 		 397 aa  52.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 		 467 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.12 
 
 		 858 aa  51.6  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  24.52 
 
 		 656 aa  51.6  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.46 
 
 		 854 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.8 
 
 		 849 aa  51.6  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 		 839 aa  51.2  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 398 aa  51.2  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.22 
 
 		 405 aa  50.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  29.73 
 
 		 453 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 		 412 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.52 
 
 		 656 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  24.5 
 
 		 849 aa  50.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.48 
 
 		 397 aa  50.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.52 
 
 		 656 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.3 
 
 		 402 aa  50.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  30.63 
 
 		 400 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 		 397 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.37 
 
 		 502 aa  50.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  27.01 
 
 		 423 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  31.55 
 
 		 384 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  28.57 
 
 		 410 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.81 
 
 		 427 aa  49.3  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  29.8 
 
 		 682 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 847 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.41 
 
 		 409 aa  49.3  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  29.35 
 
 		 682 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.43 
 
 		 409 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 847 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  29.35 
 
 		 667 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 1129 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  29.35 
 
 		 667 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.57 
 
 		 385 aa  48.9  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  28.21 
 
 		 425 aa  48.9  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 		 387 aa  48.9  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 852 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.28 
 
 		 420 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.01 
 
 		 424 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  35.44 
 
 		 666 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  27.03 
 
 		 414 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 830 aa  48.5  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  22.02 
 
 		 397 aa  48.5  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.34 
 
 		 411 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 		 406 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0590  hypothetical protein  30.71 
 
 		 424 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  28.83 
 
 		 412 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  25.93 
 
 		 367 aa  48.1  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.03 
 
 		 427 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  32.76 
 
 		 854 aa  48.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.63 
 
 		 415 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 409 aa  48.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 422 aa  48.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.26 
 
 		 642 aa  47.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>