148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0873 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  69.48 
 
 		 759 aa  900    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1433    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  26.37 
 
 		 780 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 775 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 809 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  32.29 
 
 		 809 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 		 779 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  28.22 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.95 
 
 		 418 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  26.67 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  22.41 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  28.17 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.17 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  27.23 
 
 		 417 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  25.39 
 
 		 422 aa  57  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  27.23 
 
 		 417 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  27.23 
 
 		 417 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.23 
 
 		 417 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.23 
 
 		 417 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  27.23 
 
 		 417 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  26.3 
 
 		 448 aa  56.6  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.19 
 
 		 841 aa  55.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  26.98 
 
 		 417 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.93 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0385  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 		 422 aa  55.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0295868  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.8 
 
 		 417 aa  55.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4691  hypothetical protein  27.35 
 
 		 596 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.65 
 
 		 427 aa  55.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 		 422 aa  54.7  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  25.41 
 
 		 416 aa  54.3  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  25.41 
 
 		 416 aa  54.3  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.93 
 
 		 417 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.34 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 375 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  25.36 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.93 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.93 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.69 
 
 		 842 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.49 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  22.43 
 
 		 435 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.68 
 
 		 417 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  28.14 
 
 		 786 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.27 
 
 		 410 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.32 
 
 		 836 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  20.8 
 
 		 397 aa  51.6  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  23.58 
 
 		 787 aa  51.6  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.3 
 
 		 416 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.77 
 
 		 413 aa  50.8  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  22.39 
 
 		 362 aa  51.2  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 866 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  25.71 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 853 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.06 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  27.23 
 
 		 422 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.18 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.78 
 
 		 397 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  21.1 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.1 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.47 
 
 		 502 aa  50.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.76 
 
 		 389 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  24.26 
 
 		 356 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  20.78 
 
 		 792 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  29 
 
 		 404 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.49 
 
 		 843 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  20.88 
 
 		 401 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  27.84 
 
 		 857 aa  49.3  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 		 379 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  26.89 
 
 		 419 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 423 aa  48.9  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 786 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.48 
 
 		 862 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  34.75 
 
 		 858 aa  48.9  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  17.8 
 
 		 773 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.35 
 
 		 439 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  27.1 
 
 		 377 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.42 
 
 		 399 aa  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.18 
 
 		 418 aa  48.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  26.47 
 
 		 416 aa  48.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.13 
 
 		 439 aa  48.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.35 
 
 		 417 aa  47.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 		 406 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 790 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2397  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  23.02 
 
 		 414 aa  47.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  23.46 
 
 		 791 aa  47.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  32.52 
 
 		 381 aa  47.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 788 aa  47.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  28.57 
 
 		 389 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.34 
 
 		 414 aa  47.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2783  hypothetical protein  26.16 
 
 		 375 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.753762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 		 420 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.93 
 
 		 423 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.13 
 
 		 414 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  25.23 
 
 		 661 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279794 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 786 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 881 aa  46.6  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  22.73 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>