224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1629 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  69.48 
 
 
756 aa  822    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  100 
 
 
759 aa  1454    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  28.82 
 
 
780 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  25.55 
 
 
775 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 
809 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  25.56 
 
 
809 aa  84.7  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.23 
 
 
835 aa  83.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 
779 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4691  hypothetical protein  30.32 
 
 
596 aa  77.8  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 
805 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.15 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 
422 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.71 
 
 
413 aa  65.1  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
786 aa  65.1  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.52 
 
 
447 aa  62.4  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.68 
 
 
426 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.78 
 
 
426 aa  62  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  24.37 
 
 
422 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  27.11 
 
 
787 aa  61.6  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.63 
 
 
422 aa  61.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.53 
 
 
423 aa  60.8  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.41 
 
 
428 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.2 
 
 
420 aa  60.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 
423 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.91 
 
 
426 aa  60.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  22.18 
 
 
787 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.13 
 
 
416 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.73 
 
 
433 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.71 
 
 
416 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  24.94 
 
 
791 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.63 
 
 
408 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
422 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.25 
 
 
423 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 
788 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.91 
 
 
420 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.22 
 
 
426 aa  58.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 
422 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 
452 aa  57.4  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  21.04 
 
 
947 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.15 
 
 
422 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.32 
 
 
417 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  26.62 
 
 
419 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.12 
 
 
439 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.99 
 
 
411 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.42 
 
 
439 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.54 
 
 
411 aa  55.8  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.58 
 
 
439 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.07 
 
 
417 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.82 
 
 
415 aa  55.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
787 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.24 
 
 
417 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.24 
 
 
417 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 
1143 aa  55.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.73 
 
 
426 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.07 
 
 
417 aa  54.7  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.45 
 
 
418 aa  54.3  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  26.56 
 
 
789 aa  54.7  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 
838 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  28.19 
 
 
404 aa  54.3  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  25.48 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.51 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  25.54 
 
 
417 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  27.78 
 
 
422 aa  53.9  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.64 
 
 
413 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.51 
 
 
417 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
427 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.51 
 
 
417 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.48 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 
787 aa  53.9  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.48 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.48 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  28.83 
 
 
387 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  26.34 
 
 
793 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0777  ABC lipoprotein efflux transporter, inner membrane subunit, LolE  26.67 
 
 
428 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.43 
 
 
414 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  25.96 
 
 
448 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.61 
 
 
417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  26.32 
 
 
417 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  23.45 
 
 
1016 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.03 
 
 
422 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.03 
 
 
422 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.22 
 
 
417 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.94 
 
 
393 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.71 
 
 
427 aa  52.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.43 
 
 
423 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2433  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.67 
 
 
428 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0865492  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 
410 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.46 
 
 
502 aa  51.6  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.07 
 
 
411 aa  51.6  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.02 
 
 
417 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  28.68 
 
 
415 aa  51.2  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0402  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.27 
 
 
428 aa  51.2  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  25.29 
 
 
424 aa  50.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  22.13 
 
 
1132 aa  51.2  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.25 
 
 
417 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  24.75 
 
 
401 aa  50.8  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0551  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 
422 aa  50.8  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000638831  normal  0.237108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  30.13 
 
 
410 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  25.07 
 
 
791 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>