More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1981 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1981  permease domain-containing protein  100 
 
 		 364 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3804  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  26.24 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  25.17 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  21.28 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  24.63 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  20.88 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  24.19 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.54 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  21.45 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  22.81 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.07 
 
 		 807 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  21.4 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  21.4 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  21.9 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2197  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000154518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  24.04 
 
 		 670 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.22 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  26.04 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  20.27 
 
 		 804 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  21.07 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  20.89 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.94 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  22.52 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.14 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  26.04 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  21.66 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  23.02 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  24.5 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2954  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0954365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  23 
 
 		 657 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  24.55 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.3 
 
 		 805 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  24.67 
 
 		 653 aa  60.1  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.34 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  24.42 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  20.99 
 
 		 869 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  22.07 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  20.97 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  22.12 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  22.57 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0268  ABC-type transport system, permease component  24.05 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  20.49 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  22.7 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  21.2 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  22.66 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.05 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.53 
 
 		 880 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  20.43 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25.17 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  20.8 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  21.48 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  22.6 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  23.02 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  24.92 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  31.15 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  31.15 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  31.15 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  31.15 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  22.89 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  24.47 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  20.79 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  22.06 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  22.83 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 		 799 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3083  ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.360963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  23.08 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.94 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  21.33 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  20.94 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.69 
 
 		 882 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  19.93 
 
 		 804 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.34 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.15 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.12 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  20.44 
 
 		 663 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  22.22 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  22.22 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  20.07 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  24.11 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  22.38 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.74 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.18 
 
 		 427 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  25.74 
 
 		 797 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  20.49 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1599  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000150322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  21.41 
 
 		 400 aa  52.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  21.53 
 
 		 405 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 		 802 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>