More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4079 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4079  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
435 aa  854    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4046  protein of unknown function DUF214  99.77 
 
 
435 aa  851    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3937  hypothetical protein  97.7 
 
 
435 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0497  hypothetical protein  75.86 
 
 
435 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  26.42 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  29.27 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 
459 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 
417 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 
412 aa  93.6  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.77 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25.23 
 
 
425 aa  89.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.89 
 
 
414 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.89 
 
 
414 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  25.65 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 
830 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.48 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  32.47 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.33 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  31.71 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  23.5 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  24.72 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.55 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  38.73 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  32.74 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  38.21 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  23.02 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.82 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  33.54 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  25.23 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  34.16 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  25.51 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1678  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.13 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0156822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  33.48 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  25.96 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  29.41 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.54 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 
856 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  24.48 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  27.05 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  29.41 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  37.9 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  37.58 
 
 
853 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  30.57 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0747  lipoprotein releasing system  24.46 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1332  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.64 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.33 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  24.46 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.43 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  23.5 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  26.32 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  21.36 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  34.5 
 
 
716 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.8 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  35.38 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  35.21 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  35.21 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  26.09 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.8 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.46 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  28.1 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  37.59 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  38.89 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  36.62 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1242  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2397  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  24.9 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.4 
 
 
646 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  33.13 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  26.35 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  34.5 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  35.98 
 
 
843 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  27.78 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  34.19 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  24.78 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  33.93 
 
 
842 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  30.82 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  22.57 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.42 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.78 
 
 
648 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  31.11 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  28.5 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>