64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1027 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 786 aa  1568    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  24.31 
 
 		 779 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 		 775 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  23.57 
 
 		 779 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  23.57 
 
 		 779 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  23.42 
 
 		 779 aa  124  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  23.27 
 
 		 735 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  23.69 
 
 		 779 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  23.77 
 
 		 779 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1444  hypothetical protein  20.71 
 
 		 778 aa  102  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  21.76 
 
 		 772 aa  102  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3168  protein of unknown function DUF214  20.39 
 
 		 773 aa  91.3  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  20.27 
 
 		 805 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 		 779 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  20.83 
 
 		 780 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 853 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 		 838 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 405 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 871 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 		 775 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.8 
 
 		 896 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.62 
 
 		 811 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  23.6 
 
 		 402 aa  52  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 		 402 aa  52  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 866 aa  51.6  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 398 aa  51.6  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.32 
 
 		 835 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.24 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0483  hypothetical protein  26.42 
 
 		 373 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  25.62 
 
 		 349 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  25.62 
 
 		 349 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.76 
 
 		 400 aa  48.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.06 
 
 		 848 aa  47.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 423 aa  47.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.78 
 
 		 401 aa  47.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  28.75 
 
 		 444 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  22.99 
 
 		 791 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 405 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  25.37 
 
 		 394 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  22.31 
 
 		 349 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 		 773 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  26.28 
 
 		 794 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  22.4 
 
 		 809 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  26.28 
 
 		 850 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  24.72 
 
 		 405 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 406 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.67 
 
 		 857 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25.93 
 
 		 1232 aa  46.2  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 406 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 		 413 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  20.36 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.13 
 
 		 413 aa  45.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 405 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0100  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 1193 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 405 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  20.66 
 
 		 397 aa  44.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 787 aa  44.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 401 aa  44.3  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.22 
 
 		 402 aa  44.3  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  23.77 
 
 		 400 aa  44.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  20.08 
 
 		 828 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  23.75 
 
 		 352 aa  44.3  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  26.21 
 
 		 403 aa  44.3  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>