39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0400 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  99.87 
 
 		 758 aa  1472    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1472    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  26.24 
 
 		 817 aa  145  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  28.19 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  39.78 
 
 		 664 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  36.36 
 
 		 883 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  39.73 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  26.32 
 
 		 973 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  38.96 
 
 		 922 aa  57.4  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.62 
 
 		 724 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  43.84 
 
 		 1284 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  37.66 
 
 		 922 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  37.21 
 
 		 1280 aa  54.3  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  36.49 
 
 		 830 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  24.92 
 
 		 877 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  22.9 
 
 		 974 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  37.68 
 
 		 974 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  36.62 
 
 		 974 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  36.62 
 
 		 974 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  41.1 
 
 		 1065 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  44 
 
 		 1047 aa  51.6  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  35.21 
 
 		 974 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  23.23 
 
 		 974 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  24.61 
 
 		 974 aa  51.2  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  27.2 
 
 		 808 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  25.38 
 
 		 857 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  49.02 
 
 		 1282 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  42.86 
 
 		 711 aa  48.5  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  38 
 
 		 353 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 617 aa  47.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  35.29 
 
 		 768 aa  47  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  39.22 
 
 		 535 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1414 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  46.15 
 
 		 1167 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25.9 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.21 
 
 		 723 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  30.51 
 
 		 421 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  30.85 
 
 		 650 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 729 aa  44.3  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>