75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0777 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  100 
 
 
617 aa  1211    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  34.36 
 
 
711 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  28.91 
 
 
664 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  31.9 
 
 
883 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  41.57 
 
 
821 aa  73.9  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  28.29 
 
 
922 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  37.78 
 
 
830 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  27.8 
 
 
922 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  20.22 
 
 
724 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  35.87 
 
 
978 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  35.87 
 
 
978 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  38.71 
 
 
979 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  35.96 
 
 
787 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  26.67 
 
 
768 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.68 
 
 
729 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.42 
 
 
974 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  27.69 
 
 
974 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  26.92 
 
 
974 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  27.31 
 
 
974 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  28.74 
 
 
974 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  28.63 
 
 
974 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  27.4 
 
 
878 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  26.64 
 
 
877 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  28.57 
 
 
1156 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  28.57 
 
 
1156 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  28.57 
 
 
1156 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  26.49 
 
 
973 aa  55.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  28.57 
 
 
1156 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  28.57 
 
 
1156 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  28.57 
 
 
1156 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  32.98 
 
 
878 aa  54.3  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  26.67 
 
 
1155 aa  53.9  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  25.78 
 
 
974 aa  53.9  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  28.79 
 
 
1153 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  32.63 
 
 
1280 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.08 
 
 
723 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  24.4 
 
 
874 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  34.48 
 
 
1185 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  32.1 
 
 
1284 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  21.7 
 
 
712 aa  51.6  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  21.43 
 
 
1065 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  30.91 
 
 
812 aa  50.4  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  27.82 
 
 
1156 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  23.85 
 
 
812 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 
1149 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  26.21 
 
 
917 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  23.44 
 
 
874 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  24.47 
 
 
968 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  34.65 
 
 
890 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  19.92 
 
 
1153 aa  48.5  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  35.48 
 
 
1155 aa  48.5  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  29.5 
 
 
1186 aa  48.5  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  36.73 
 
 
818 aa  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  30.16 
 
 
1348 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  28.99 
 
 
1163 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  33.33 
 
 
758 aa  47.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  33.82 
 
 
880 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  33.33 
 
 
758 aa  47.4  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 
682 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  25.17 
 
 
877 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  25 
 
 
880 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  29.35 
 
 
1179 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  30.91 
 
 
1282 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  36.23 
 
 
901 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  38 
 
 
1151 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  30.67 
 
 
199 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  30.67 
 
 
199 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.36 
 
 
1194 aa  44.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  30.19 
 
 
1277 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  32.22 
 
 
1171 aa  44.3  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  25 
 
 
798 aa  44.3  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  32.08 
 
 
1167 aa  43.9  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  38.03 
 
 
917 aa  44.3  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  41.51 
 
 
1047 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  35 
 
 
1351 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>