215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2572 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1309    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  31.56 
 
 		 758 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  31 
 
 		 623 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  33.23 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.53 
 
 		 615 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  33.18 
 
 		 695 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30 
 
 		 596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  32.76 
 
 		 596 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  33.03 
 
 		 594 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  34.72 
 
 		 682 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  31.97 
 
 		 594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 		 598 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  27.51 
 
 		 712 aa  107  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.82 
 
 		 637 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  32.47 
 
 		 703 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  27.76 
 
 		 613 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.2 
 
 		 607 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.62 
 
 		 640 aa  91.3  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  31.22 
 
 		 780 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.75 
 
 		 677 aa  88.2  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.75 
 
 		 677 aa  88.2  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.85 
 
 		 793 aa  84.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  29.79 
 
 		 807 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.41 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.75 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.5 
 
 		 685 aa  77.4  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  22.2 
 
 		 744 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  26.49 
 
 		 714 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  34.59 
 
 		 696 aa  75.5  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  30.28 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.15 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.79 
 
 		 674 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25.82 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  27.02 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.51 
 
 		 773 aa  72.4  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  26.96 
 
 		 763 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.36 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  21.45 
 
 		 691 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.21 
 
 		 748 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  23.77 
 
 		 769 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  23.74 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.49 
 
 		 708 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.88 
 
 		 762 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  28.57 
 
 		 782 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  28.11 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.89 
 
 		 594 aa  67  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  22.75 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  27.01 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.91 
 
 		 589 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  40.22 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  31 
 
 		 773 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  32.03 
 
 		 688 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.83 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  26.18 
 
 		 784 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  29.05 
 
 		 497 aa  60.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.65 
 
 		 652 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.56 
 
 		 659 aa  55.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.86 
 
 		 566 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  24.3 
 
 		 569 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  44.83 
 
 		 421 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  24.3 
 
 		 569 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  24.54 
 
 		 533 aa  54.3  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.04 
 
 		 584 aa  53.9  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  23.67 
 
 		 522 aa  53.9  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.17 
 
 		 669 aa  53.9  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  30.3 
 
 		 505 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.24 
 
 		 603 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.84 
 
 		 601 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  26.15 
 
 		 453 aa  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.76 
 
 		 666 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  26.9 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  41.18 
 
 		 442 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  20.69 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  20.69 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  20.69 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  21.97 
 
 		 558 aa  51.6  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  21.56 
 
 		 552 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  21.56 
 
 		 552 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  21.56 
 
 		 552 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  29.24 
 
 		 642 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  21.56 
 
 		 552 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  21.56 
 
 		 552 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  39.58 
 
 		 532 aa  50.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.33 
 
 		 681 aa  50.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  30.41 
 
 		 564 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  35.42 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  25 
 
 		 535 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.78 
 
 		 591 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  25.86 
 
 		 593 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.64 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  22.62 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  24.16 
 
 		 661 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  40.82 
 
 		 1191 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  22.02 
 
 		 554 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.62 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  22.62 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  22.62 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>