55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0481 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  100 
 
 		 818 aa  1579    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  32.86 
 
 		 817 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  25.55 
 
 		 758 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  25.55 
 
 		 758 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  23.51 
 
 		 821 aa  73.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  32.39 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  40.62 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  32.39 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  33.08 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  33.08 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  33.08 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  33.08 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  33.08 
 
 		 974 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  32.31 
 
 		 974 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  30.77 
 
 		 974 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  36.54 
 
 		 922 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  36.63 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  22.76 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.87 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  39.18 
 
 		 883 aa  60.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  30.28 
 
 		 973 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.3 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  38.36 
 
 		 94 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  24.46 
 
 		 922 aa  55.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  26.49 
 
 		 901 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.99 
 
 		 724 aa  54.3  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  32.5 
 
 		 830 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1185 aa  51.6  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1167 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  31.52 
 
 		 880 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1156 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1156 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  34.43 
 
 		 712 aa  48.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1156 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 		 1179 aa  48.1  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  21.58 
 
 		 768 aa  47.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1348 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  36.73 
 
 		 617 aa  47.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  51.28 
 
 		 339 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  34.12 
 
 		 877 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1156 aa  47.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1156 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  26.62 
 
 		 880 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  35.44 
 
 		 978 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  20.13 
 
 		 1186 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  35.44 
 
 		 978 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  35.44 
 
 		 979 aa  47  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  32.88 
 
 		 1167 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  31.33 
 
 		 1171 aa  45.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1156 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  24.39 
 
 		 874 aa  45.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  30.38 
 
 		 968 aa  45.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1065 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1277 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1149 aa  44.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>