66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0829 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  100 
 
 
817 aa  1606    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  31.9 
 
 
818 aa  343  9e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  26.68 
 
 
758 aa  161  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  26.68 
 
 
758 aa  160  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  34.95 
 
 
664 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  39.24 
 
 
787 aa  63.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  43.24 
 
 
830 aa  62.4  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  35.94 
 
 
724 aa  57.4  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  30.83 
 
 
768 aa  56.6  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  36.59 
 
 
922 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  28.18 
 
 
974 aa  55.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  28.97 
 
 
974 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  28.04 
 
 
767 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  28.04 
 
 
767 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  28.04 
 
 
974 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  41.67 
 
 
712 aa  54.7  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  28.04 
 
 
974 aa  54.3  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  28.04 
 
 
974 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  35.37 
 
 
922 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  28.04 
 
 
974 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  28.04 
 
 
974 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  27.1 
 
 
973 aa  52.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.38 
 
 
723 aa  51.6  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.76 
 
 
711 aa  51.6  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 
1179 aa  50.8  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  26.46 
 
 
979 aa  50.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  42.37 
 
 
1189 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  35.62 
 
 
821 aa  50.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  37.04 
 
 
1282 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 
1187 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  40.35 
 
 
1187 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  38.6 
 
 
1187 aa  48.5  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  30.56 
 
 
978 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  30.56 
 
 
978 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  32.93 
 
 
1167 aa  48.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  22.92 
 
 
1144 aa  48.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 
1189 aa  48.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  38.6 
 
 
1189 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  34.18 
 
 
1065 aa  47.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  33.33 
 
 
901 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  28.7 
 
 
1284 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  35.29 
 
 
1184 aa  47.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  34.25 
 
 
1414 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  34.48 
 
 
729 aa  46.6  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.77 
 
 
1190 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 
1301 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.35 
 
 
1173 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 
1177 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  37.25 
 
 
1277 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1174 aa  45.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  37.29 
 
 
1201 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  27.36 
 
 
1047 aa  45.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  36.84 
 
 
1191 aa  45.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  25.73 
 
 
658 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 
1184 aa  44.7  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 
1175 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  33.33 
 
 
883 aa  44.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>