89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3341 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  100 
 
 
1047 aa  2112    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  25.27 
 
 
1280 aa  135  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  25.71 
 
 
1284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.23 
 
 
1354 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.83 
 
 
1171 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  31.22 
 
 
1065 aa  101  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  25.43 
 
 
1467 aa  98.2  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  26.95 
 
 
1351 aa  98.2  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  22.05 
 
 
1282 aa  97.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  22.69 
 
 
1163 aa  89.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  25.17 
 
 
1167 aa  82.4  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  39.1 
 
 
1414 aa  81.3  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.83 
 
 
968 aa  78.2  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  23.3 
 
 
974 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  21.56 
 
 
974 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  25.97 
 
 
1153 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  29 
 
 
830 aa  76.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  32.67 
 
 
1157 aa  76.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  35.29 
 
 
1153 aa  75.5  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  29.33 
 
 
1160 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  21.25 
 
 
974 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  31.95 
 
 
1179 aa  73.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.33 
 
 
812 aa  73.9  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  22.46 
 
 
1158 aa  73.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  25.41 
 
 
821 aa  68.9  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  27.57 
 
 
1156 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  27.57 
 
 
1156 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  27.57 
 
 
1156 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.31 
 
 
729 aa  68.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.07 
 
 
767 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.07 
 
 
767 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  24.03 
 
 
974 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  27.57 
 
 
1156 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  21.96 
 
 
974 aa  66.6  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.07 
 
 
974 aa  67  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  27.07 
 
 
974 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  32.99 
 
 
1167 aa  65.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  32.03 
 
 
1156 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  32.03 
 
 
1156 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  36.03 
 
 
1277 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  32.52 
 
 
1186 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  28.97 
 
 
1137 aa  63.9  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  27.01 
 
 
1156 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.04 
 
 
787 aa  63.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  24.36 
 
 
877 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  24.77 
 
 
1144 aa  61.6  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  25.48 
 
 
1185 aa  61.6  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  25.08 
 
 
973 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  32.64 
 
 
1181 aa  60.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  28.08 
 
 
1210 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  22.87 
 
 
979 aa  58.5  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  27.63 
 
 
1149 aa  57.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  22.5 
 
 
883 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  36.64 
 
 
1348 aa  56.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  28.66 
 
 
711 aa  55.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  25.19 
 
 
1153 aa  55.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  26.25 
 
 
1155 aa  55.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  37.65 
 
 
917 aa  55.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  33.54 
 
 
768 aa  53.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  27.41 
 
 
917 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  27.32 
 
 
1126 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.09 
 
 
723 aa  53.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  24.36 
 
 
199 aa  52.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  24.36 
 
 
199 aa  52.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  31.15 
 
 
1126 aa  52.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  44 
 
 
758 aa  51.6  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  44 
 
 
758 aa  51.6  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  44 
 
 
664 aa  50.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  36.36 
 
 
1127 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  25.27 
 
 
1181 aa  50.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  26.05 
 
 
1157 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  27.27 
 
 
1201 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  26.38 
 
 
1194 aa  50.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.35 
 
 
924 aa  49.7  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  19.33 
 
 
922 aa  49.3  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  39.73 
 
 
901 aa  49.3  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  18.67 
 
 
922 aa  48.5  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  33.06 
 
 
1153 aa  48.5  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  47.92 
 
 
356 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  27.08 
 
 
987 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  31.96 
 
 
895 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  42.86 
 
 
874 aa  47  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  44.78 
 
 
874 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.91 
 
 
724 aa  47.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  27.1 
 
 
890 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  23.08 
 
 
798 aa  46.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  40.85 
 
 
870 aa  45.8  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  25 
 
 
1047 aa  45.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  27.36 
 
 
817 aa  44.7  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>