93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1224 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  65.7 
 
 		 724 aa  920    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  100 
 
 		 723 aa  1436    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  22.65 
 
 		 664 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  30.21 
 
 		 712 aa  88.6  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  36.77 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1194 aa  77  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  34.5 
 
 		 1167 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  31.61 
 
 		 1171 aa  70.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1186 aa  68.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.1 
 
 		 787 aa  67.8  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.09 
 
 		 922 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.44 
 
 		 922 aa  65.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  28 
 
 		 711 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1157 aa  61.6  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1210 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  29.87 
 
 		 818 aa  61.6  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1160 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  26.5 
 
 		 883 aa  60.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1348 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.97 
 
 		 978 aa  60.8  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1153 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  31.34 
 
 		 917 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1167 aa  58.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  29.27 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1277 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  24.73 
 
 		 821 aa  57.4  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1354 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  35.05 
 
 		 830 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.31 
 
 		 1057 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  32.76 
 
 		 1047 aa  55.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1149 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  31.2 
 
 		 829 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1351 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  35.48 
 
 		 812 aa  54.3  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  24.78 
 
 		 812 aa  53.9  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1181 aa  53.9  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1201 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1185 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1047 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  32.12 
 
 		 1179 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  31.08 
 
 		 617 aa  52.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  31.65 
 
 		 618 aa  52  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  47.92 
 
 		 912 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1181 aa  52  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  30 
 
 		 1157 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  34.38 
 
 		 817 aa  51.6  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  24 
 
 		 677 aa  50.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1155 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  36.27 
 
 		 729 aa  50.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  27.87 
 
 		 880 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1284 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  29.81 
 
 		 840 aa  49.7  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  44.83 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  25.24 
 
 		 968 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  23.4 
 
 		 979 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.56 
 
 		 924 aa  48.5  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.85 
 
 		 880 aa  48.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  31.25 
 
 		 673 aa  48.1  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1414 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  30.61 
 
 		 537 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  28.78 
 
 		 974 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  30.22 
 
 		 875 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  23.33 
 
 		 978 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  37.31 
 
 		 1280 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  23.33 
 
 		 978 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  29.79 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1156 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1156 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  36.51 
 
 		 870 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1156 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  34.21 
 
 		 758 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1156 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1144 aa  45.8  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  34.21 
 
 		 758 aa  45.8  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1156 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1156 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1153 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  26.62 
 
 		 885 aa  45.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1467 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.56 
 
 		 895 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  25 
 
 		 789 aa  45.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1156 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  29.67 
 
 		 873 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1127 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1155 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  28.64 
 
 		 874 aa  44.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.87 
 
 		 767 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.87 
 
 		 767 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  27.05 
 
 		 974 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  36.92 
 
 		 987 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.87 
 
 		 974 aa  43.9  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  27.87 
 
 		 974 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  27.87 
 
 		 974 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>