162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1626 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  100 
 
 		 978 aa  1878    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  46.41 
 
 		 618 aa  156  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  36.21 
 
 		 840 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  28.17 
 
 		 1016 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.87 
 
 		 1007 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  27.31 
 
 		 1008 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.31 
 
 		 1008 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  27.16 
 
 		 926 aa  87.4  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  25.79 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  25.96 
 
 		 895 aa  85.5  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  23.2 
 
 		 1019 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  37.11 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.16 
 
 		 890 aa  82.4  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  27.57 
 
 		 1003 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  26.36 
 
 		 1007 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  28.62 
 
 		 891 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  22.73 
 
 		 902 aa  78.2  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  28.19 
 
 		 857 aa  77.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  27.23 
 
 		 1008 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  23.7 
 
 		 924 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  23.39 
 
 		 891 aa  72.8  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.63 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1023 aa  71.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.96 
 
 		 1061 aa  70.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  24.07 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  23.93 
 
 		 805 aa  68.6  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  28.11 
 
 		 864 aa  67.4  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  21.85 
 
 		 794 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  27.94 
 
 		 1019 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  35.48 
 
 		 955 aa  67  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 852 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  22.61 
 
 		 1033 aa  66.6  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.72 
 
 		 993 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 852 aa  67  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  22.35 
 
 		 795 aa  66.6  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  27.43 
 
 		 859 aa  65.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  26.45 
 
 		 859 aa  64.7  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.42 
 
 		 993 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  23.02 
 
 		 1022 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.44 
 
 		 906 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  23.66 
 
 		 910 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  24.66 
 
 		 859 aa  63.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  28.77 
 
 		 961 aa  62.4  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  24.65 
 
 		 757 aa  61.6  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  32.54 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.97 
 
 		 723 aa  60.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  26.82 
 
 		 802 aa  60.1  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.3 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  22.93 
 
 		 1114 aa  60.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 		 804 aa  60.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  23.16 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.26 
 
 		 702 aa  58.9  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.6 
 
 		 1031 aa  58.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  27.87 
 
 		 1049 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  26.2 
 
 		 851 aa  58.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  25.49 
 
 		 1038 aa  58.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 935 aa  57.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.11 
 
 		 1030 aa  56.6  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  22.73 
 
 		 904 aa  56.2  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  25.17 
 
 		 1219 aa  56.2  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  22.99 
 
 		 702 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  22.75 
 
 		 989 aa  56.2  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.04 
 
 		 1074 aa  55.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  29.84 
 
 		 1057 aa  55.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 		 858 aa  55.1  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  27.93 
 
 		 1081 aa  54.3  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  30 
 
 		 922 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22.37 
 
 		 693 aa  53.5  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  31.96 
 
 		 604 aa  53.1  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  24.48 
 
 		 953 aa  53.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  53.06 
 
 		 1021 aa  52.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  24.39 
 
 		 1180 aa  52.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  31.01 
 
 		 993 aa  52.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  27.22 
 
 		 994 aa  51.6  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  35.53 
 
 		 987 aa  51.6  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  22.59 
 
 		 862 aa  51.2  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  25.94 
 
 		 1018 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  22.32 
 
 		 1018 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  35.64 
 
 		 298 aa  50.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  35.53 
 
 		 987 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  28.93 
 
 		 664 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  28.46 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  23.51 
 
 		 1018 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25 
 
 		 1108 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  25.41 
 
 		 1116 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  21.08 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  28.77 
 
 		 1172 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  27.02 
 
 		 663 aa  49.7  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  19.51 
 
 		 824 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  31.16 
 
 		 258 aa  49.7  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  25.88 
 
 		 1226 aa  49.7  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  25.1 
 
 		 1227 aa  49.3  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.65 
 
 		 360 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  23.83 
 
 		 1018 aa  48.9  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  43.18 
 
 		 885 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  33.33 
 
 		 252 aa  48.9  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  33.33 
 
 		 252 aa  48.9  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  22.42 
 
 		 888 aa  48.5  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.25 
 
 		 370 aa  48.5  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>