98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1379 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  69.77 
 
 
978 aa  1383    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  69.77 
 
 
978 aa  1383    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  100 
 
 
979 aa  1987    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  24.77 
 
 
974 aa  248  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  24.8 
 
 
974 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  24.75 
 
 
974 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  23.76 
 
 
974 aa  238  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.74 
 
 
974 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  22.81 
 
 
877 aa  186  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.2 
 
 
974 aa  183  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  26.56 
 
 
974 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  25.73 
 
 
973 aa  161  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  36.18 
 
 
199 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  36.18 
 
 
199 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  31.96 
 
 
1280 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  30.03 
 
 
1282 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  29.62 
 
 
1065 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.58 
 
 
1354 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.86 
 
 
787 aa  110  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  32 
 
 
821 aa  105  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  24.73 
 
 
1284 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30.26 
 
 
1351 aa  100  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.59 
 
 
830 aa  99.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  27.05 
 
 
812 aa  95.5  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  38.18 
 
 
767 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  38.18 
 
 
767 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  28.32 
 
 
729 aa  83.2  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  32.2 
 
 
1467 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  26.29 
 
 
1185 aa  80.1  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  22.37 
 
 
922 aa  79  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  24.31 
 
 
883 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.34 
 
 
922 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  25.99 
 
 
1414 aa  75.1  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  31.72 
 
 
968 aa  74.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  26.37 
 
 
664 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  28.19 
 
 
1156 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  27.52 
 
 
1156 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  27.52 
 
 
1156 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  27.52 
 
 
1156 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  27.52 
 
 
1156 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  27.52 
 
 
1156 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  24.86 
 
 
1160 aa  68.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  26.85 
 
 
1156 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  24.71 
 
 
1153 aa  67.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  26.2 
 
 
768 aa  66.6  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  30.95 
 
 
1157 aa  65.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  38.71 
 
 
617 aa  65.5  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  32.17 
 
 
1153 aa  64.3  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  27.44 
 
 
1181 aa  63.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  23.98 
 
 
1149 aa  62.4  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  28.66 
 
 
1201 aa  61.6  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  21.74 
 
 
1186 aa  60.1  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  23.83 
 
 
1144 aa  60.1  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  35.51 
 
 
890 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  22.87 
 
 
1047 aa  58.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  22.67 
 
 
1163 aa  58.9  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  28.24 
 
 
917 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  23.35 
 
 
1167 aa  57.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  23 
 
 
1167 aa  55.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  33.03 
 
 
711 aa  55.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  23.9 
 
 
1158 aa  54.3  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  28.18 
 
 
1210 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  25.22 
 
 
1348 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  30 
 
 
1171 aa  53.5  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  24.4 
 
 
873 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.28 
 
 
1194 aa  52.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  41.54 
 
 
875 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  41.54 
 
 
880 aa  52  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  30.08 
 
 
188 aa  51.2  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  23.37 
 
 
1126 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  32.65 
 
 
874 aa  50.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  26.46 
 
 
817 aa  50.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  25.37 
 
 
1155 aa  50.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  25 
 
 
1181 aa  50.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  28.47 
 
 
1126 aa  50.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  23.89 
 
 
1277 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.4 
 
 
723 aa  48.9  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  16.22 
 
 
1179 aa  49.3  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  24.23 
 
 
719 aa  48.9  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  24.44 
 
 
891 aa  48.9  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  36.23 
 
 
901 aa  48.9  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  37.93 
 
 
1155 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  26.06 
 
 
1151 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  21.46 
 
 
1153 aa  48.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  20.92 
 
 
804 aa  47.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  26.12 
 
 
1157 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  39.44 
 
 
1153 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  35.62 
 
 
818 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  26.21 
 
 
1127 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  21.6 
 
 
1158 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  36.92 
 
 
878 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  33.85 
 
 
870 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  30.7 
 
 
798 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  34.25 
 
 
888 aa  46.2  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  35.38 
 
 
874 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  35.38 
 
 
874 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  30.49 
 
 
880 aa  45.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>