115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1149 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  100 
 
 		 1163 aa  2326    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  38.88 
 
 		 1171 aa  681    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1210 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  35.2 
 
 		 1167 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1186 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1185 aa  323  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1160 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1181 aa  303  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1151 aa  274  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  28.13 
 
 		 1179 aa  266  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1156 aa  259  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1156 aa  255  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1153 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1156 aa  251  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1156 aa  240  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1152 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1155 aa  235  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1152 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1158 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1167 aa  157  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1156 aa  147  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1144 aa  147  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1157 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1284 aa  141  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1149 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  46.98 
 
 		 1181 aa  131  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1156 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1156 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1155 aa  125  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1157 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1153 aa  112  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1351 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  37.01 
 
 		 1201 aa  108  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1065 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1354 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1280 aa  106  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1153 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1282 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1126 aa  101  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  36.78 
 
 		 188 aa  99  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1126 aa  96.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  22.51 
 
 		 974 aa  91.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  22.74 
 
 		 974 aa  91.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  22.51 
 
 		 974 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1047 aa  89.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  22.22 
 
 		 974 aa  89.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1348 aa  89  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  22.22 
 
 		 974 aa  89  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  22.51 
 
 		 877 aa  88.2  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  23.77 
 
 		 973 aa  88.2  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  22.97 
 
 		 974 aa  88.2  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  22.45 
 
 		 974 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  32 
 
 		 1127 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  36.77 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  28.74 
 
 		 830 aa  79  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1414 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  23.5 
 
 		 968 aa  78.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1467 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  35.25 
 
 		 729 aa  74.7  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  33.58 
 
 		 664 aa  74.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  37.41 
 
 		 724 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 787 aa  64.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  36.49 
 
 		 768 aa  63.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.47 
 
 		 812 aa  63.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  28.72 
 
 		 978 aa  62.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  28.72 
 
 		 978 aa  62.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  40.91 
 
 		 711 aa  62.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  23.83 
 
 		 821 aa  62.4  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1277 aa  62  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  25.74 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  25.74 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  30.69 
 
 		 922 aa  60.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  22.67 
 
 		 979 aa  58.9  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  29.7 
 
 		 922 aa  57.4  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  33.33 
 
 		 883 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  28.24 
 
 		 767 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  28.24 
 
 		 767 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1194 aa  53.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  37.68 
 
 		 917 aa  52  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  19.97 
 
 		 935 aa  51.6  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  29.41 
 
 		 1165 aa  51.6  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  32.73 
 
 		 880 aa  51.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  43.55 
 
 		 1018 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  41.94 
 
 		 1018 aa  50.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  45.28 
 
 		 712 aa  50.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  38.82 
 
 		 874 aa  48.9  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1137 aa  48.9  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  31.02 
 
 		 1047 aa  48.9  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  20.06 
 
 		 978 aa  48.9  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.99 
 
 		 1020 aa  48.1  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  30 
 
 		 1180 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  40.74 
 
 		 1018 aa  47.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  28.99 
 
 		 617 aa  47.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  37.1 
 
 		 1018 aa  47  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  25.98 
 
 		 875 aa  47.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  35.63 
 
 		 1020 aa  46.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  29.84 
 
 		 873 aa  46.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  38.71 
 
 		 1018 aa  46.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>