99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1989 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  100 
 
 		 1348 aa  2543    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1277 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1167 aa  118  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  34.76 
 
 		 1171 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  40 
 
 		 1185 aa  107  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1149 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1186 aa  102  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1160 aa  99.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  33.21 
 
 		 1167 aa  99  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1155 aa  94  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1156 aa  92  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1156 aa  91.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  37.57 
 
 		 1156 aa  91.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  37.57 
 
 		 1156 aa  91.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  37.57 
 
 		 1156 aa  91.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1156 aa  90.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1210 aa  90.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1156 aa  90.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  36.36 
 
 		 1179 aa  89.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1065 aa  89.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  31.05 
 
 		 1163 aa  88.6  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  36.18 
 
 		 1153 aa  85.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  37.75 
 
 		 1126 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1153 aa  80.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1144 aa  78.2  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1153 aa  75.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1157 aa  74.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1155 aa  73.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1127 aa  72.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1152 aa  71.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1181 aa  71.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1157 aa  71.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1181 aa  70.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1354 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1282 aa  69.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1151 aa  68.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  30.1 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.78 
 
 		 968 aa  66.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1284 aa  66.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1152 aa  66.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  32.17 
 
 		 787 aa  64.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  31.3 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  26.04 
 
 		 974 aa  62  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  25.52 
 
 		 974 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  26.04 
 
 		 767 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.04 
 
 		 974 aa  61.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  26.04 
 
 		 974 aa  61.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  31.75 
 
 		 768 aa  61.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.04 
 
 		 974 aa  61.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  26.04 
 
 		 767 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0578  hypothetical protein  58.33 
 
 		 121 aa  60.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0904277  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  26.04 
 
 		 974 aa  60.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.67 
 
 		 723 aa  60.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  37.09 
 
 		 1158 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  25.97 
 
 		 974 aa  60.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1201 aa  59.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1280 aa  59.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1126 aa  58.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  22.09 
 
 		 922 aa  58.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  22.26 
 
 		 922 aa  58.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1467 aa  58.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  33.08 
 
 		 883 aa  58.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.33 
 
 		 729 aa  57  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  36.64 
 
 		 1047 aa  57  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  24.26 
 
 		 973 aa  57  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  31.14 
 
 		 917 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  26.96 
 
 		 978 aa  55.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  26.96 
 
 		 978 aa  55.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  29.73 
 
 		 821 aa  55.1  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  69.7 
 
 		 322 aa  54.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  25.22 
 
 		 979 aa  54.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  28.46 
 
 		 664 aa  53.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  40.28 
 
 		 711 aa  54.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  45.31 
 
 		 1575 aa  53.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1137 aa  52.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  32.56 
 
 		 94 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  33.88 
 
 		 881 aa  50.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  47.22 
 
 		 875 aa  49.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35520  hypothetical protein  73.08 
 
 		 115 aa  48.9  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0788848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1414 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  30.16 
 
 		 617 aa  47.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3406  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  47.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17040  hypothetical protein  60 
 
 		 121 aa  47.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.482925 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  35.06 
 
 		 818 aa  47.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  43.06 
 
 		 880 aa  47.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  43.75 
 
 		 712 aa  47  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  41.67 
 
 		 356 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2426  hypothetical protein  60 
 
 		 112 aa  47  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000395226  normal  0.0109582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0240  protein lsr2 precursor  69.23 
 
 		 111 aa  47  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  42.57 
 
 		 724 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2670  hypothetical protein  60 
 
 		 113 aa  47  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000070834  normal  0.0381923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  40.43 
 
 		 457 aa  46.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1194 aa  45.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0167  Lsr2-like protein  46 
 
 		 108 aa  45.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2975  hypothetical protein  61.29 
 
 		 111 aa  45.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1351 aa  45.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0525  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  57.5 
 
 		 113 aa  45.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  36.23 
 
 		 880 aa  45.1  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>