95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0049 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  100 
 
 		 1155 aa  2227    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1186 aa  376  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1151 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1152 aa  275  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1153 aa  271  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  28.39 
 
 		 1163 aa  259  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  27.73 
 
 		 1167 aa  254  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1152 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1155 aa  247  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.02 
 
 		 1171 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1210 aa  239  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1181 aa  238  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1160 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  25 
 
 		 1157 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  39.4 
 
 		 1181 aa  170  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1153 aa  151  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1156 aa  137  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1156 aa  137  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1156 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  36.86 
 
 		 1149 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  32 
 
 		 1153 aa  132  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1156 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1156 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  33.47 
 
 		 1185 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1157 aa  129  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  34.82 
 
 		 1156 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1156 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  43.27 
 
 		 188 aa  126  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1127 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  51.77 
 
 		 1158 aa  125  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  40.33 
 
 		 1167 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  46.92 
 
 		 1179 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  39.63 
 
 		 1126 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  39.63 
 
 		 1126 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1144 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1201 aa  108  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1277 aa  95.5  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1348 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1282 aa  82  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1351 aa  78.2  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1354 aa  72.4  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  37.8 
 
 		 729 aa  68.6  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1065 aa  68.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1284 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  23.18 
 
 		 812 aa  63.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1414 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  26.12 
 
 		 821 aa  60.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  23.92 
 
 		 968 aa  59.7  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1280 aa  59.7  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  25.15 
 
 		 922 aa  58.9  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  30.97 
 
 		 787 aa  58.9  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  20.53 
 
 		 979 aa  57  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1467 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  32.56 
 
 		 883 aa  55.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  33.06 
 
 		 664 aa  55.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  25.45 
 
 		 922 aa  55.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  27.23 
 
 		 768 aa  55.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1047 aa  55.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  36.36 
 
 		 830 aa  54.3  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  26.67 
 
 		 617 aa  53.5  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  26.28 
 
 		 974 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  27.1 
 
 		 917 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  40 
 
 		 711 aa  53.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  26.32 
 
 		 767 aa  53.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  26.32 
 
 		 767 aa  53.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  28.07 
 
 		 974 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 973 aa  52.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  26.32 
 
 		 974 aa  52.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.32 
 
 		 974 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  34.17 
 
 		 702 aa  52  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  46.15 
 
 		 712 aa  52.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  27.19 
 
 		 974 aa  52  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  26.32 
 
 		 974 aa  52  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.32 
 
 		 974 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1194 aa  51.6  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1153 aa  51.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  23.81 
 
 		 978 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  23.81 
 
 		 978 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.25 
 
 		 723 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  22.57 
 
 		 719 aa  50.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1137 aa  50.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  31.53 
 
 		 875 aa  49.7  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.86 
 
 		 918 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  32.33 
 
 		 875 aa  49.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  37.5 
 
 		 873 aa  48.9  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  30.89 
 
 		 874 aa  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  29.45 
 
 		 901 aa  46.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  36.05 
 
 		 878 aa  46.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  30.08 
 
 		 874 aa  46.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  32.26 
 
 		 870 aa  45.8  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  35.29 
 
 		 94 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 702 aa  45.8  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.53 
 
 		 880 aa  45.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  30.28 
 
 		 702 aa  45.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  21.99 
 
 		 877 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>