175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1236 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 874 aa  1706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  91.3 
 
 		 874 aa  1529    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  47.14 
 
 		 878 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  36.16 
 
 		 878 aa  438  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  34.49 
 
 		 875 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.55 
 
 		 880 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  30.95 
 
 		 880 aa  277  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  29.74 
 
 		 875 aa  188  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.94 
 
 		 873 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  38.29 
 
 		 880 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  36.27 
 
 		 901 aa  95.1  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  37.22 
 
 		 877 aa  93.2  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  41.46 
 
 		 888 aa  87.8  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  40.19 
 
 		 881 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  30.14 
 
 		 875 aa  84.7  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  36.23 
 
 		 874 aa  82.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  34.48 
 
 		 870 aa  77.4  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  28.32 
 
 		 946 aa  70.5  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  31.61 
 
 		 917 aa  68.2  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  26.5 
 
 		 910 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1354 aa  65.1  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 		 1198 aa  61.6  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 		 1201 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1351 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1051 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.85 
 
 		 918 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  32.79 
 
 		 912 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1284 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  32.2 
 
 		 1184 aa  56.6  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 		 1184 aa  56.6  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 		 1189 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  38.1 
 
 		 1174 aa  55.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  24.86 
 
 		 1167 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 		 1167 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  33.7 
 
 		 712 aa  55.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 		 1198 aa  54.7  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  34.02 
 
 		 892 aa  54.7  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 		 1198 aa  54.3  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  29.68 
 
 		 1187 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  34.95 
 
 		 1190 aa  54.3  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 		 1200 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  28.95 
 
 		 1222 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 		 917 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1195 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1192 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  34.48 
 
 		 1181 aa  52.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.36 
 
 		 1187 aa  52.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  24.4 
 
 		 617 aa  52.4  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  28.07 
 
 		 1213 aa  52.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1186 aa  52  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  37.68 
 
 		 729 aa  52  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1172 aa  52  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 		 1191 aa  52  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  29.85 
 
 		 1208 aa  51.6  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.63 
 
 		 1185 aa  51.6  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1263 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.08 
 
 		 1187 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  29.2 
 
 		 1218 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  28.32 
 
 		 1183 aa  50.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 		 1191 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  38.03 
 
 		 359 aa  50.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  28.07 
 
 		 1188 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1203 aa  50.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  34.25 
 
 		 883 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  26.95 
 
 		 968 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 		 1185 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  27.43 
 
 		 1217 aa  49.7  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 		 1194 aa  50.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1234 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  29.2 
 
 		 1188 aa  49.7  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1141 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  26.79 
 
 		 1214 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1196 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  25.64 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  24.48 
 
 		 1191 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  27.43 
 
 		 1227 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 		 1188 aa  49.3  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  26.64 
 
 		 812 aa  49.7  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.98 
 
 		 1190 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1194 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.62 
 
 		 1187 aa  49.7  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  30.83 
 
 		 1198 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  30.37 
 
 		 1215 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  35.56 
 
 		 1148 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  36.13 
 
 		 1168 aa  49.3  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1194 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  34.41 
 
 		 1186 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  27.88 
 
 		 1195 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  27.88 
 
 		 1195 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  27.62 
 
 		 1217 aa  48.5  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  35.48 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  33.33 
 
 		 955 aa  48.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.39 
 
 		 1191 aa  48.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  27.88 
 
 		 1195 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1199 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1199 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1222 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1181 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  34.19 
 
 		 1175 aa  47.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>