124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1061 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  100 
 
 
712 aa  1428    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  33.7 
 
 
724 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  30.21 
 
 
723 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  32.93 
 
 
1194 aa  74.3  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  31.13 
 
 
664 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  40.48 
 
 
1160 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  32.98 
 
 
711 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  29.09 
 
 
1157 aa  60.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  46.3 
 
 
1171 aa  58.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  38.04 
 
 
878 aa  58.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  46.3 
 
 
1167 aa  58.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  34.78 
 
 
874 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  33.96 
 
 
901 aa  57  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  35.92 
 
 
917 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  36.69 
 
 
880 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  43.75 
 
 
880 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  28.08 
 
 
935 aa  55.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  37.93 
 
 
1167 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  33.7 
 
 
874 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  30.12 
 
 
1181 aa  54.7  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  41.67 
 
 
817 aa  54.7  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  45.9 
 
 
1127 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  44.44 
 
 
1277 aa  54.3  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  34.34 
 
 
1210 aa  53.9  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  29.41 
 
 
883 aa  53.9  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  35.29 
 
 
787 aa  53.9  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  48 
 
 
1065 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  34 
 
 
812 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  24.73 
 
 
922 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  46.15 
 
 
1155 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  32 
 
 
922 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  31.65 
 
 
821 aa  52  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 
702 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  21.7 
 
 
617 aa  51.6  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 
702 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 
702 aa  51.2  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  48.08 
 
 
768 aa  50.8  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 
700 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  25.86 
 
 
978 aa  50.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  25.86 
 
 
978 aa  50.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  27.27 
 
 
830 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  29.8 
 
 
1179 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  29.76 
 
 
802 aa  50.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  54.17 
 
 
1201 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  44 
 
 
875 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  41.38 
 
 
1181 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  29.81 
 
 
987 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  45.28 
 
 
1163 aa  50.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  40 
 
 
595 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  28.86 
 
 
1201 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  30.68 
 
 
1157 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  44.26 
 
 
1126 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  26.6 
 
 
812 aa  48.5  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  30.56 
 
 
987 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  34.43 
 
 
818 aa  48.5  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  38.6 
 
 
1153 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  42 
 
 
875 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  30.83 
 
 
840 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  35.29 
 
 
878 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  36.67 
 
 
1153 aa  47.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  36.9 
 
 
1149 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  52.27 
 
 
1200 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  37.29 
 
 
968 aa  47.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  34.34 
 
 
955 aa  47.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  30.06 
 
 
1153 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  42.62 
 
 
1126 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  35.42 
 
 
377 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  28.75 
 
 
374 aa  47.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  43.75 
 
 
1348 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  34.62 
 
 
522 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  45.65 
 
 
387 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  36 
 
 
814 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  38.46 
 
 
1156 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  38.46 
 
 
1156 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  38.46 
 
 
1156 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  34.07 
 
 
371 aa  46.2  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 
1187 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 
1187 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  36.25 
 
 
644 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  38.46 
 
 
1156 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  52.08 
 
 
1189 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  44.23 
 
 
729 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  36.78 
 
 
421 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  38.46 
 
 
1156 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  43.75 
 
 
1174 aa  45.8  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.48 
 
 
634 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  36.36 
 
 
1158 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  38.46 
 
 
1156 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1592  AAA ATPase  23.36 
 
 
577 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0000077927  hitchhiker  0.00122285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  38.27 
 
 
1189 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  38.27 
 
 
1189 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  38.27 
 
 
1189 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.5 
 
 
371 aa  45.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  35.71 
 
 
1144 aa  44.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  47.92 
 
 
1190 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  26.32 
 
 
483 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  38.27 
 
 
1189 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  38.27 
 
 
1189 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  38.27 
 
 
1189 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  38.27 
 
 
1189 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>