21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6288 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  78.63 
 
 		 648 aa  789    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  100 
 
 		 644 aa  1206    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  31.47 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  27.06 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  27.31 
 
 		 526 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  41.77 
 
 		 695 aa  55.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1167 aa  54.3  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  22.76 
 
 		 1021 aa  52  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.67 
 
 		 634 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  25.41 
 
 		 700 aa  47.4  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  42.55 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  29.85 
 
 		 702 aa  45.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  40.91 
 
 		 878 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.28 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.65 
 
 		 414 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 		 374 aa  44.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.86 
 
 		 398 aa  44.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  38.03 
 
 		 1198 aa  43.9  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  38.03 
 
 		 1198 aa  43.9  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  38.03 
 
 		 1222 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  38.03 
 
 		 1213 aa  43.9  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>