65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0398 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 878 aa  1687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  42.01 
 
 		 880 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  37.51 
 
 		 875 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  36.29 
 
 		 874 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  36.45 
 
 		 874 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  35.41 
 
 		 878 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  30.65 
 
 		 880 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  30.12 
 
 		 875 aa  192  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.72 
 
 		 873 aa  174  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  31.84 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  29.15 
 
 		 875 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  27.41 
 
 		 910 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  27.11 
 
 		 870 aa  130  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  27.79 
 
 		 901 aa  127  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 917 aa  107  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  26.74 
 
 		 881 aa  92  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  40.8 
 
 		 888 aa  81.6  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  35.94 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  39.62 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  26.94 
 
 		 946 aa  68.9  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  35.03 
 
 		 874 aa  67.8  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  31.58 
 
 		 883 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  38.04 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  40 
 
 		 1351 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  31.78 
 
 		 821 aa  55.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  26.16 
 
 		 875 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1051 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  32.98 
 
 		 617 aa  54.3  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  34.59 
 
 		 904 aa  52  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1284 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  29.23 
 
 		 815 aa  51.6  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  26.51 
 
 		 877 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  26.51 
 
 		 877 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  26.51 
 
 		 877 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1354 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  32.04 
 
 		 968 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  32.41 
 
 		 955 aa  48.5  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  41.27 
 
 		 891 aa  48.5  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  35.8 
 
 		 711 aa  48.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  28.35 
 
 		 1103 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  37 
 
 		 1180 aa  47  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  47.83 
 
 		 1137 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  38.1 
 
 		 1170 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  30.65 
 
 		 1047 aa  46.2  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1157 aa  46.2  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  28.52 
 
 		 1179 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  27.94 
 
 		 862 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1282 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  31.94 
 
 		 883 aa  45.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1144 aa  45.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  26.97 
 
 		 993 aa  45.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 		 824 aa  45.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.97 
 
 		 993 aa  45.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1147 aa  44.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  36.07 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  34.72 
 
 		 1147 aa  44.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1160 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  44 
 
 		 1065 aa  44.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  43.9 
 
 		 648 aa  44.3  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  28.57 
 
 		 987 aa  44.3  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1185 aa  44.3  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  32.18 
 
 		 979 aa  44.3  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  38.18 
 
 		 1511 aa  44.3  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  27.13 
 
 		 978 aa  44.3  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  27.13 
 
 		 978 aa  44.3  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>