171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0944 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  100 
 
 		 483 aa  972    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  33.84 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  25.1 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  35.03 
 
 		 695 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  22.78 
 
 		 993 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  31.48 
 
 		 648 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  30.64 
 
 		 993 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  24.12 
 
 		 891 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  36.96 
 
 		 1019 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  23.93 
 
 		 994 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 		 993 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  30.95 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  23.85 
 
 		 702 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.98 
 
 		 702 aa  58.9  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  25.51 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  42.67 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  20.25 
 
 		 1019 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  22.98 
 
 		 1061 aa  57  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.44 
 
 		 813 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  46 
 
 		 814 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  25.75 
 
 		 857 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  23.65 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  33.33 
 
 		 912 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  33.96 
 
 		 805 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  36.49 
 
 		 858 aa  54.3  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  25.21 
 
 		 700 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  31.71 
 
 		 935 aa  53.9  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  26.59 
 
 		 1099 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  46.67 
 
 		 1191 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.77 
 
 		 859 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  35.44 
 
 		 339 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  30.39 
 
 		 922 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  29.87 
 
 		 702 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  29.14 
 
 		 789 aa  51.6  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  33.33 
 
 		 1003 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.49 
 
 		 1021 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  30 
 
 		 888 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  38.46 
 
 		 987 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  35.71 
 
 		 980 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  25.23 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1191 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  34.48 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  36.08 
 
 		 1149 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  35.79 
 
 		 1147 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  39.08 
 
 		 1188 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  38.46 
 
 		 987 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  39.08 
 
 		 1188 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  39.08 
 
 		 1189 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  43.75 
 
 		 1190 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  31.13 
 
 		 1007 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1185 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  37.33 
 
 		 539 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.73 
 
 		 626 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 565 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1185 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  28.35 
 
 		 693 aa  47.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  39.34 
 
 		 580 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  36.96 
 
 		 533 aa  47  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 		 537 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  36.73 
 
 		 626 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  36.9 
 
 		 1189 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  37.21 
 
 		 1146 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  28.99 
 
 		 1100 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  40.85 
 
 		 1147 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  36.36 
 
 		 704 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  40.62 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  36.9 
 
 		 1189 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 852 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  40.32 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 852 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1189 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1189 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1198 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  39.58 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  22.68 
 
 		 1008 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  43.75 
 
 		 1176 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  43.75 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  42.86 
 
 		 1082 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1179 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.11 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  32.61 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1187 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  41.3 
 
 		 1174 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  37.66 
 
 		 1063 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1190 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  36.54 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  38.03 
 
 		 1162 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1176 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  22.68 
 
 		 1008 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  25.4 
 
 		 642 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  35.63 
 
 		 1153 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  42.62 
 
 		 555 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  35.71 
 
 		 1189 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  35.71 
 
 		 1189 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  36.59 
 
 		 1151 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1190 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  31.07 
 
 		 784 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  35.62 
 
 		 1139 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  35.71 
 
 		 1189 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>