More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1155 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  98.71 
 
 
852 aa  1636    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  100 
 
 
852 aa  1656    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.64 
 
 
961 aa  181  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  23.44 
 
 
906 aa  169  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  26.73 
 
 
1039 aa  150  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  23.32 
 
 
1029 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  24.52 
 
 
1018 aa  142  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.53 
 
 
1030 aa  133  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  23.81 
 
 
1029 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  24 
 
 
1029 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  24.15 
 
 
1018 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24 
 
 
1029 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  24 
 
 
1029 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24 
 
 
1029 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  26.54 
 
 
864 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  23.8 
 
 
1029 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  22.96 
 
 
1029 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.95 
 
 
858 aa  124  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  22.1 
 
 
1018 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  23 
 
 
1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  22.78 
 
 
1029 aa  118  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  22.1 
 
 
1029 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  23.37 
 
 
1009 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  24.74 
 
 
890 aa  107  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  22.31 
 
 
1033 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25 
 
 
693 aa  105  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  23.55 
 
 
1019 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  22.25 
 
 
1031 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.03 
 
 
1011 aa  103  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  26.29 
 
 
1049 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  21.72 
 
 
1018 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  21.71 
 
 
1020 aa  101  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.93 
 
 
857 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  22.16 
 
 
1022 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 
993 aa  98.2  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  21.05 
 
 
1018 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  21.05 
 
 
1018 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  21.05 
 
 
1018 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  22.11 
 
 
1018 aa  95.5  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  24.78 
 
 
1038 aa  95.9  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.04 
 
 
859 aa  95.9  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  22.32 
 
 
1023 aa  94.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.97 
 
 
935 aa  94.4  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  31.93 
 
 
891 aa  94  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  30.33 
 
 
1108 aa  93.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  29.3 
 
 
993 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.82 
 
 
993 aa  89  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  29.17 
 
 
891 aa  89  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  24.39 
 
 
1024 aa  86.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  26.22 
 
 
1016 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  21.48 
 
 
1059 aa  86.3  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  21.81 
 
 
1022 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  30.94 
 
 
1006 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  30.81 
 
 
994 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.09 
 
 
924 aa  84  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  22.74 
 
 
1018 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 
1180 aa  81.6  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.45 
 
 
995 aa  81.3  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25.82 
 
 
1074 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  33.33 
 
 
815 aa  80.5  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.26 
 
 
1013 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 
702 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  29.9 
 
 
953 aa  79  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  30.93 
 
 
1007 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  24.04 
 
 
1047 aa  78.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  20.41 
 
 
1046 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  23.82 
 
 
1057 aa  77.8  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.39 
 
 
1114 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  27.91 
 
 
902 aa  77  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  25.29 
 
 
1008 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.94 
 
 
810 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.51 
 
 
789 aa  77  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  28.99 
 
 
978 aa  75.5  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  35.29 
 
 
904 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  32.96 
 
 
1103 aa  75.1  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  21.98 
 
 
989 aa  75.1  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  28.16 
 
 
1116 aa  75.1  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  27.32 
 
 
1020 aa  74.7  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  22.22 
 
 
1009 aa  74.7  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  22.22 
 
 
1009 aa  74.7  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.38 
 
 
804 aa  73.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  30.18 
 
 
910 aa  73.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  28.36 
 
 
950 aa  73.6  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  33.86 
 
 
1081 aa  72.4  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.39 
 
 
1021 aa  72.4  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  26.05 
 
 
1020 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  29.94 
 
 
1099 aa  72.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  22.57 
 
 
1224 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  25.7 
 
 
1018 aa  72  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  27.11 
 
 
1003 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  19.96 
 
 
1018 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  23.9 
 
 
1048 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  23.9 
 
 
1047 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  23.9 
 
 
1047 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  23.9 
 
 
1047 aa  70.5  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  27.62 
 
 
1023 aa  70.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  23.9 
 
 
1048 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  23.9 
 
 
1047 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  23.9 
 
 
1047 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  22.88 
 
 
1018 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>