65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0498 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 642 aa  1283    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  57.88 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  26 
 
 		 663 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  24.05 
 
 		 699 aa  97.8  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  21.48 
 
 		 673 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  20.06 
 
 		 660 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  21.99 
 
 		 676 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  23.75 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  20.95 
 
 		 690 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1689  hypothetical protein  53.41 
 
 		 96 aa  70.5  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0750579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  33.02 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  33.02 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  24.19 
 
 		 657 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  33.02 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  22.96 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  21.84 
 
 		 666 aa  63.9  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  27.27 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  30 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  28.79 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  32.32 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  20.88 
 
 		 693 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  22.89 
 
 		 677 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  20.88 
 
 		 693 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  24.26 
 
 		 704 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  25.68 
 
 		 683 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  19.91 
 
 		 660 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  25.23 
 
 		 672 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  21.84 
 
 		 354 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  23.99 
 
 		 790 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  27.01 
 
 		 658 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  31.78 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  23.25 
 
 		 1170 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  19.19 
 
 		 690 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  26.45 
 
 		 663 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22.4 
 
 		 693 aa  47.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  39.06 
 
 		 1144 aa  47.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 		 709 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  38.98 
 
 		 1003 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 		 1247 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  39.62 
 
 		 1141 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  42.59 
 
 		 1202 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  26.24 
 
 		 314 aa  45.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.83 
 
 		 890 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  35 
 
 		 514 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  25.4 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  43.64 
 
 		 789 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  23.84 
 
 		 1008 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  30.3 
 
 		 671 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  23.68 
 
 		 794 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  25 
 
 		 1007 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  34.65 
 
 		 1082 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  26.19 
 
 		 1152 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  31.87 
 
 		 1346 aa  45.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 		 1152 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25.25 
 
 		 924 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1144 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  37.74 
 
 		 1138 aa  44.3  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  44.23 
 
 		 857 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1140 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  25.78 
 
 		 1168 aa  44.3  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  23.62 
 
 		 1170 aa  44.3  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  37.74 
 
 		 1139 aa  43.9  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  23.24 
 
 		 795 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  40 
 
 		 813 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  25.77 
 
 		 1016 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>