64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3443 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  100 
 
 
709 aa  1447    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  32.07 
 
 
769 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  29.3 
 
 
736 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  26.65 
 
 
420 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  26.09 
 
 
577 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  31.55 
 
 
427 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  38.75 
 
 
439 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  25.07 
 
 
464 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  21.41 
 
 
447 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  34.18 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  35.48 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  37.93 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  24.54 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  44.44 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  30.98 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  25.36 
 
 
410 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  24.94 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  47.95 
 
 
478 aa  73.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  47.3 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  47.3 
 
 
482 aa  72  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  28.62 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  43.42 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  40.43 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  40.22 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  44.16 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  29.1 
 
 
335 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  45.33 
 
 
454 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  40.43 
 
 
455 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  37.65 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  25.14 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  58 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  38.37 
 
 
408 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  41.77 
 
 
414 aa  66.6  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  23.1 
 
 
976 aa  66.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  34.65 
 
 
445 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  42.11 
 
 
403 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  38.27 
 
 
445 aa  65.1  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  41.25 
 
 
437 aa  64.7  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  32.29 
 
 
442 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  25.93 
 
 
253 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  38.46 
 
 
410 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  25 
 
 
556 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  26.13 
 
 
533 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  29.29 
 
 
418 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  35.37 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  26.11 
 
 
262 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.11 
 
 
429 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  33.33 
 
 
581 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  23.61 
 
 
530 aa  53.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  30 
 
 
608 aa  52.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  27.11 
 
 
712 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 
702 aa  51.6  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  25.68 
 
 
313 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  25.55 
 
 
252 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  31 
 
 
532 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 
642 aa  47.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 
702 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  29.2 
 
 
452 aa  45.8  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  27.36 
 
 
562 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  44.44 
 
 
369 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  44.44 
 
 
368 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  28.16 
 
 
879 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>