91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2210 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  57.01 
 
 		 661 aa  732    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  56.56 
 
 		 661 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  54.86 
 
 		 668 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  100 
 
 		 662 aa  1340    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  59.13 
 
 		 660 aa  733    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  33.73 
 
 		 664 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  34.18 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  32.51 
 
 		 666 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  29.62 
 
 		 676 aa  252  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  28.82 
 
 		 677 aa  250  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  28.01 
 
 		 673 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  27.92 
 
 		 660 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  27.71 
 
 		 660 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  32.26 
 
 		 671 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  24.89 
 
 		 663 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  23.79 
 
 		 671 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  29.89 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  37.01 
 
 		 683 aa  94.4  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  24.23 
 
 		 690 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  22.08 
 
 		 693 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  22.08 
 
 		 693 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  35.83 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  28.74 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  28.12 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  35.82 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  28.04 
 
 		 1017 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  26.36 
 
 		 672 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  23.99 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  35.78 
 
 		 1013 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  30.26 
 
 		 1049 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  32.32 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  33.33 
 
 		 1020 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  28.41 
 
 		 260 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  33.91 
 
 		 1018 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  30.4 
 
 		 1018 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  35.29 
 
 		 1018 aa  54.7  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  27.35 
 
 		 804 aa  54.7  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  44.83 
 
 		 962 aa  54.7  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  28.75 
 
 		 953 aa  53.9  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.86 
 
 		 1030 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  34.43 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  34.43 
 
 		 1018 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  28.12 
 
 		 1033 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  37.35 
 
 		 986 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  35.29 
 
 		 1018 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  35.48 
 
 		 1029 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  35.48 
 
 		 1029 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  35.48 
 
 		 1029 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  35.48 
 
 		 1029 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  35.48 
 
 		 1029 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  35.48 
 
 		 1029 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32 
 
 		 1018 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  35.48 
 
 		 1029 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  31.45 
 
 		 1018 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  28.07 
 
 		 1047 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.62 
 
 		 1038 aa  52  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  32.63 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32.79 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  32.23 
 
 		 1029 aa  50.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  34.41 
 
 		 1029 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  32.48 
 
 		 1022 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  34.41 
 
 		 1029 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  31.03 
 
 		 1039 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.22 
 
 		 1018 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  42.59 
 
 		 1059 aa  49.3  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  27.42 
 
 		 1025 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  35.4 
 
 		 1020 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  38.81 
 
 		 1018 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1029 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  37.93 
 
 		 995 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  38.33 
 
 		 1046 aa  48.5  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  36.84 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  25.75 
 
 		 686 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  38.6 
 
 		 986 aa  47.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.53 
 
 		 1024 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  37.1 
 
 		 1009 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  31.3 
 
 		 1081 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  38.6 
 
 		 1023 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  32.29 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  34.48 
 
 		 989 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  24.51 
 
 		 857 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  42.11 
 
 		 1006 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  32.14 
 
 		 906 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  30 
 
 		 881 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  33.82 
 
 		 891 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.09 
 
 		 995 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 1020 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 699 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  26.79 
 
 		 859 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>