203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2519 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  79.76 
 
 		 1018 aa  1524    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  54.43 
 
 		 1018 aa  971    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  97.84 
 
 		 1018 aa  1854    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1018 aa  2044    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  93.52 
 
 		 1018 aa  1780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  45.38 
 
 		 1020 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  61.89 
 
 		 1018 aa  1101    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  51.76 
 
 		 1018 aa  881    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  62.18 
 
 		 1018 aa  1108    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  62.28 
 
 		 1018 aa  1078    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  62.38 
 
 		 1018 aa  1112    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  53.24 
 
 		 1018 aa  960    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  55.4 
 
 		 1018 aa  1000    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  62.28 
 
 		 1018 aa  1110    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  39.16 
 
 		 1018 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  38.43 
 
 		 1018 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.54 
 
 		 1020 aa  456  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  33.78 
 
 		 1020 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  29.08 
 
 		 1029 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  28.98 
 
 		 1029 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  28.98 
 
 		 1029 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.6 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.69 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  29.23 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.98 
 
 		 1029 aa  396  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.64 
 
 		 1029 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  28.79 
 
 		 1029 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.63 
 
 		 1029 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.25 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  30.31 
 
 		 1049 aa  383  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  29.45 
 
 		 1039 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  42.5 
 
 		 1013 aa  342  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  29.52 
 
 		 1038 aa  334  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.83 
 
 		 1030 aa  271  7e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  25.96 
 
 		 1011 aa  248  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  36.46 
 
 		 1017 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  32.19 
 
 		 1033 aa  221  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  51.55 
 
 		 953 aa  197  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  26.35 
 
 		 906 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.08 
 
 		 1009 aa  182  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  41.1 
 
 		 1081 aa  179  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  46.58 
 
 		 1006 aa  176  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  28.31 
 
 		 1047 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  33.57 
 
 		 1009 aa  168  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  33.57 
 
 		 1009 aa  168  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23 
 
 		 1108 aa  164  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.18 
 
 		 961 aa  161  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  35.57 
 
 		 881 aa  159  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  33.33 
 
 		 995 aa  159  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  40.18 
 
 		 1024 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.52 
 
 		 986 aa  152  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  37.16 
 
 		 989 aa  151  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  38.66 
 
 		 1291 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  40.4 
 
 		 995 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  42.13 
 
 		 986 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  32 
 
 		 1046 aa  147  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  34.33 
 
 		 1046 aa  145  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  46.07 
 
 		 1023 aa  144  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  44.81 
 
 		 962 aa  144  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  34.62 
 
 		 1022 aa  142  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  28 
 
 		 1085 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  37.68 
 
 		 1025 aa  137  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  49.43 
 
 		 1058 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  36.51 
 
 		 1249 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  33.77 
 
 		 1223 aa  126  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  44.03 
 
 		 1191 aa  125  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.53 
 
 		 1059 aa  125  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  31.11 
 
 		 1165 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  32.99 
 
 		 1009 aa  118  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  32.29 
 
 		 1219 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  27.15 
 
 		 1091 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 1346 aa  115  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  32.34 
 
 		 1211 aa  115  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  33.55 
 
 		 1046 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  29.67 
 
 		 1230 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  34.09 
 
 		 1164 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  32.77 
 
 		 1211 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.07 
 
 		 810 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  33.23 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  33.23 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  33.23 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  33.23 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  34.16 
 
 		 815 aa  112  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  35.37 
 
 		 1227 aa  111  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  33.86 
 
 		 1116 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  33.77 
 
 		 1227 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  34.84 
 
 		 1155 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  36.84 
 
 		 1229 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  36.84 
 
 		 1220 aa  109  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  36.84 
 
 		 1229 aa  109  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  33.77 
 
 		 1227 aa  108  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  33.8 
 
 		 1047 aa  108  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  33.8 
 
 		 1047 aa  108  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  33.8 
 
 		 1048 aa  108  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  45.24 
 
 		 1224 aa  108  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1048 aa  108  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  29.46 
 
 		 1303 aa  107  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 		 1232 aa  107  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  37.06 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  35.81 
 
 		 1227 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>