219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0052 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  100 
 
 		 1049 aa  2120    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  32.17 
 
 		 1039 aa  426  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  31.89 
 
 		 1029 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32 
 
 		 1029 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  30.45 
 
 		 1020 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  31.05 
 
 		 1029 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.39 
 
 		 1038 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  30.83 
 
 		 1018 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  31.58 
 
 		 1029 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  31.61 
 
 		 1029 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.97 
 
 		 1018 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  30.39 
 
 		 1029 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  31.64 
 
 		 1029 aa  399  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  31.64 
 
 		 1029 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.88 
 
 		 1018 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  31.54 
 
 		 1029 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  31.54 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  31.54 
 
 		 1029 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  30.5 
 
 		 1018 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  29.79 
 
 		 1018 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  28.84 
 
 		 1033 aa  325  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.87 
 
 		 1059 aa  277  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  29.9 
 
 		 1081 aa  256  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  33.45 
 
 		 1018 aa  251  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  26.86 
 
 		 953 aa  233  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32.31 
 
 		 1018 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32.31 
 
 		 1018 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  31.65 
 
 		 1018 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.31 
 
 		 1018 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  35.79 
 
 		 1020 aa  210  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  32.8 
 
 		 1020 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  37.16 
 
 		 1018 aa  205  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  56.77 
 
 		 1017 aa  204  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  43.64 
 
 		 1018 aa  201  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  40.48 
 
 		 1018 aa  199  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  48.46 
 
 		 1018 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  48.64 
 
 		 1018 aa  196  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  26.01 
 
 		 1091 aa  193  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  36.79 
 
 		 1009 aa  189  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  41.91 
 
 		 1009 aa  186  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  41.91 
 
 		 1009 aa  186  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  26.58 
 
 		 961 aa  185  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  41.4 
 
 		 1013 aa  178  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  27.83 
 
 		 986 aa  175  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  34.82 
 
 		 1025 aa  174  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  41.8 
 
 		 962 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.53 
 
 		 881 aa  157  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  38.68 
 
 		 1291 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  33.19 
 
 		 1022 aa  153  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  41.4 
 
 		 1024 aa  153  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  28.53 
 
 		 1047 aa  152  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  41.1 
 
 		 989 aa  151  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  34.5 
 
 		 1046 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  38.1 
 
 		 995 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  46.41 
 
 		 1023 aa  149  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  27.21 
 
 		 1046 aa  145  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  46.99 
 
 		 986 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  39.57 
 
 		 1249 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  44.95 
 
 		 1006 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  37.24 
 
 		 1011 aa  138  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  40.69 
 
 		 1191 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  40.38 
 
 		 1009 aa  132  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  25.83 
 
 		 1091 aa  131  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  42.27 
 
 		 995 aa  130  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  26.35 
 
 		 1085 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  32.6 
 
 		 1224 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  43.62 
 
 		 1058 aa  127  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  30.7 
 
 		 1346 aa  126  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  40.51 
 
 		 1223 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  27.39 
 
 		 1230 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.22 
 
 		 1030 aa  122  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  29.61 
 
 		 1307 aa  122  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  29.83 
 
 		 1303 aa  120  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.58 
 
 		 1108 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  44.44 
 
 		 1088 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  30.61 
 
 		 1223 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  39.86 
 
 		 1226 aa  111  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  28.98 
 
 		 1219 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  38.25 
 
 		 1227 aa  109  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.64 
 
 		 906 aa  108  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  42.26 
 
 		 1214 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  43.21 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  38.86 
 
 		 1101 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  39.77 
 
 		 1232 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  38.12 
 
 		 1227 aa  106  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  40.33 
 
 		 1214 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  33.47 
 
 		 1238 aa  105  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  32 
 
 		 1083 aa  105  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  41.67 
 
 		 1213 aa  104  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  43.33 
 
 		 1226 aa  104  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  40.33 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  36.9 
 
 		 1234 aa  104  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  40.33 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  39.52 
 
 		 1048 aa  103  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  38.12 
 
 		 1265 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  40.12 
 
 		 1042 aa  103  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  33.16 
 
 		 1116 aa  102  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  25.84 
 
 		 1032 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  40.33 
 
 		 1214 aa  102  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  39.55 
 
 		 1211 aa  102  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>