201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0204 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  69.76 
 
 		 1091 aa  1500    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  100 
 
 		 1088 aa  2192    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  40.4 
 
 		 1230 aa  787    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  71.8 
 
 		 1091 aa  1553    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  64.82 
 
 		 1085 aa  1402    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  40.52 
 
 		 1227 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  40.76 
 
 		 1223 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  29.98 
 
 		 1238 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  40.58 
 
 		 1223 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  39.74 
 
 		 1226 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  38.74 
 
 		 1219 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  38.56 
 
 		 1224 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  49.33 
 
 		 1303 aa  328  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  45.48 
 
 		 1307 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  40.77 
 
 		 1346 aa  305  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  29.12 
 
 		 1101 aa  303  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  36.2 
 
 		 1047 aa  294  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  36.41 
 
 		 1048 aa  290  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  36.15 
 
 		 1048 aa  289  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  34.57 
 
 		 1047 aa  289  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  35.26 
 
 		 1047 aa  289  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  36.15 
 
 		 1048 aa  289  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  35.26 
 
 		 1047 aa  289  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  50.78 
 
 		 1047 aa  274  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  50.78 
 
 		 1047 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  35.96 
 
 		 1137 aa  273  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  50.19 
 
 		 1046 aa  267  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  50.19 
 
 		 1046 aa  267  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  45.7 
 
 		 1227 aa  266  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  49.49 
 
 		 1042 aa  267  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  50.19 
 
 		 1046 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  50.19 
 
 		 1046 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  50.6 
 
 		 1220 aa  263  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  50.19 
 
 		 1164 aa  263  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  50.6 
 
 		 1229 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  32.17 
 
 		 1232 aa  263  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  50.6 
 
 		 1229 aa  263  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  50.19 
 
 		 1144 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  44.6 
 
 		 1265 aa  259  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  46.53 
 
 		 1227 aa  259  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  49.6 
 
 		 1232 aa  258  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  44.48 
 
 		 1227 aa  254  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  54.05 
 
 		 1165 aa  252  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  48.79 
 
 		 1308 aa  250  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  51.27 
 
 		 1227 aa  249  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  43.58 
 
 		 1234 aa  248  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  33.54 
 
 		 1247 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  30.96 
 
 		 1213 aa  220  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  28.97 
 
 		 1244 aa  204  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  23.67 
 
 		 1039 aa  186  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  39.93 
 
 		 1214 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  40.76 
 
 		 1214 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  37.73 
 
 		 1214 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  40.24 
 
 		 1214 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  38.62 
 
 		 1214 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  43.72 
 
 		 1248 aa  173  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  28.33 
 
 		 1182 aa  173  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  38.21 
 
 		 1214 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.55 
 
 		 1108 aa  170  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  42.42 
 
 		 1248 aa  168  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  46.78 
 
 		 1211 aa  164  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  46.78 
 
 		 1211 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  39.73 
 
 		 1083 aa  161  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  53.75 
 
 		 1280 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  37.07 
 
 		 1155 aa  156  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  55.35 
 
 		 1226 aa  154  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  48.97 
 
 		 1046 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  37.29 
 
 		 1245 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  46.06 
 
 		 1245 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  46.2 
 
 		 1248 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  26.36 
 
 		 1020 aa  128  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.45 
 
 		 1013 aa  121  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  41.71 
 
 		 1247 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  26.48 
 
 		 1018 aa  118  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 1018 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  26.94 
 
 		 1018 aa  116  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  26.24 
 
 		 1018 aa  112  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  28.96 
 
 		 1020 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  36.27 
 
 		 953 aa  110  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  42.76 
 
 		 1018 aa  110  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  41.76 
 
 		 1038 aa  109  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  45.07 
 
 		 1018 aa  109  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  30.79 
 
 		 1018 aa  108  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  28.88 
 
 		 810 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  31.4 
 
 		 1180 aa  105  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  41.18 
 
 		 1009 aa  105  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  41.18 
 
 		 1009 aa  105  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  29.21 
 
 		 1047 aa  105  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  43.26 
 
 		 1018 aa  105  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  43.26 
 
 		 1018 aa  105  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  30.36 
 
 		 950 aa  104  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  23.97 
 
 		 1029 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  26.8 
 
 		 1018 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  43.36 
 
 		 1025 aa  104  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  32.13 
 
 		 1172 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  29.15 
 
 		 824 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.69 
 
 		 1114 aa  102  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  40 
 
 		 910 aa  102  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  32.13 
 
 		 1172 aa  102  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  34.5 
 
 		 1018 aa  101  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>