More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0205 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1180 aa  2274    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  35.85 
 
 		 1108 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  34.76 
 
 		 1165 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  36.71 
 
 		 1172 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  36.6 
 
 		 1172 aa  475  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  31.2 
 
 		 1116 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.75 
 
 		 1114 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  34.92 
 
 		 1223 aa  203  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  23.98 
 
 		 1238 aa  161  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 		 906 aa  154  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  25.56 
 
 		 1029 aa  138  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.61 
 
 		 1030 aa  130  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  24.72 
 
 		 1018 aa  127  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  28.31 
 
 		 961 aa  127  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  26.52 
 
 		 1047 aa  125  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  26.28 
 
 		 1048 aa  125  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  32.26 
 
 		 910 aa  125  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1048 aa  125  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.28 
 
 		 1047 aa  125  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  26.28 
 
 		 1047 aa  125  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.28 
 
 		 1047 aa  125  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  26.28 
 
 		 1047 aa  124  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  29.79 
 
 		 1032 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  37.97 
 
 		 1103 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  26.46 
 
 		 1048 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  26.03 
 
 		 1047 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  25.61 
 
 		 1088 aa  119  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  27.4 
 
 		 1018 aa  119  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  24.25 
 
 		 1224 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.53 
 
 		 810 aa  118  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  29.12 
 
 		 1039 aa  117  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  31.92 
 
 		 1346 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  35.21 
 
 		 1291 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  31.42 
 
 		 1018 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  30.23 
 
 		 1227 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  29.31 
 
 		 1046 aa  115  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  24.68 
 
 		 1018 aa  115  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  24.68 
 
 		 1018 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  37.22 
 
 		 1223 aa  114  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 824 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  27.67 
 
 		 881 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.93 
 
 		 1013 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 		 1029 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  36.41 
 
 		 1024 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.91 
 
 		 904 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  25.15 
 
 		 1223 aa  112  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  29.02 
 
 		 1046 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  27.93 
 
 		 1018 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  29.02 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  27.97 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  29.02 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  25.33 
 
 		 1091 aa  112  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  25.59 
 
 		 1018 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  28.48 
 
 		 1009 aa  111  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.43 
 
 		 1029 aa  110  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.76 
 
 		 1018 aa  108  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.99 
 
 		 1234 aa  108  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  32.98 
 
 		 1006 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  34.9 
 
 		 1018 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 953 aa  107  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  36.76 
 
 		 1265 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  23.72 
 
 		 1226 aa  107  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  26.91 
 
 		 1020 aa  107  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  35.29 
 
 		 815 aa  106  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  33.61 
 
 		 1083 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  35.33 
 
 		 1011 aa  105  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  31.44 
 
 		 1164 aa  105  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  32.27 
 
 		 1029 aa  105  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  36.89 
 
 		 1211 aa  105  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  26.16 
 
 		 1085 aa  105  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  36.89 
 
 		 1020 aa  105  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  32.62 
 
 		 1029 aa  104  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32.27 
 
 		 1029 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  27.86 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  32.62 
 
 		 1029 aa  104  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.5 
 
 		 1029 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  33.87 
 
 		 1009 aa  103  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  32.62 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  32.62 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  34.95 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  36.17 
 
 		 1219 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  31.7 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  28.47 
 
 		 1230 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  31.94 
 
 		 1099 aa  102  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  32.11 
 
 		 1025 aa  102  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  36.41 
 
 		 1211 aa  102  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  31.91 
 
 		 1029 aa  102  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  28.16 
 
 		 1091 aa  101  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  26.4 
 
 		 1018 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  26.4 
 
 		 1018 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  26.4 
 
 		 1018 aa  101  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  25.89 
 
 		 1018 aa  101  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  33.33 
 
 		 1046 aa  100  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  34.63 
 
 		 851 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  36.36 
 
 		 1046 aa  99.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  33.58 
 
 		 1307 aa  99.4  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  29.51 
 
 		 1213 aa  99.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  29.93 
 
 		 1042 aa  98.6  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  34.43 
 
 		 995 aa  98.6  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  27.86 
 
 		 1049 aa  98.6  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>