295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0673 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  100 
 
 
1116 aa  2242    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  56.99 
 
 
1114 aa  1174    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  30.99 
 
 
1180 aa  445  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  30.67 
 
 
1172 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  30.46 
 
 
1172 aa  376  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  42.46 
 
 
1223 aa  259  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  26.71 
 
 
1018 aa  243  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  26.68 
 
 
1018 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.06 
 
 
1029 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.85 
 
 
1029 aa  222  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  44.27 
 
 
1108 aa  214  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  44.53 
 
 
1165 aa  187  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  23.61 
 
 
1091 aa  154  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  28.08 
 
 
1018 aa  147  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  26.54 
 
 
1018 aa  147  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  22.84 
 
 
1085 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  27.66 
 
 
1029 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  27.9 
 
 
1018 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.46 
 
 
1029 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  34.66 
 
 
1032 aa  135  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  27.88 
 
 
1029 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  37.17 
 
 
906 aa  129  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  34.87 
 
 
910 aa  127  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  27.24 
 
 
1018 aa  127  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  26.4 
 
 
1049 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.94 
 
 
1029 aa  125  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.61 
 
 
1029 aa  125  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.94 
 
 
1029 aa  125  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  27.07 
 
 
1029 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.94 
 
 
1029 aa  125  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  30.99 
 
 
1018 aa  121  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  27.72 
 
 
1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  30.99 
 
 
1018 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  37.43 
 
 
953 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  30.67 
 
 
1018 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  28.86 
 
 
1018 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  31.87 
 
 
961 aa  118  6.9999999999999995e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.75 
 
 
1013 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  33.92 
 
 
1018 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  28.61 
 
 
1018 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  28.61 
 
 
1018 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  27 
 
 
1211 aa  116  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  28.61 
 
 
1018 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  28.43 
 
 
810 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  30.66 
 
 
1234 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  37.93 
 
 
1103 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  33.05 
 
 
1099 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  26.01 
 
 
1219 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  34.12 
 
 
1029 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  40 
 
 
881 aa  110  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  33.05 
 
 
824 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  27.29 
 
 
1088 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  34.41 
 
 
1232 aa  108  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  25.68 
 
 
989 aa  108  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  27.71 
 
 
1039 aa  106  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  28.45 
 
 
1046 aa  106  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  28.16 
 
 
1046 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  30.8 
 
 
1047 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  28.16 
 
 
1046 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  34.72 
 
 
1020 aa  104  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  31.72 
 
 
1011 aa  104  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  28.16 
 
 
1046 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  28.16 
 
 
1046 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.31 
 
 
1291 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  29.85 
 
 
1009 aa  103  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  29.85 
 
 
1009 aa  103  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  30.38 
 
 
1048 aa  102  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.17 
 
 
1030 aa  102  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  30.38 
 
 
1048 aa  102  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  30.38 
 
 
1047 aa  102  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  30.38 
 
 
1047 aa  102  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  34.02 
 
 
1047 aa  102  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  30.38 
 
 
1047 aa  102  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  33.65 
 
 
1024 aa  101  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  30.38 
 
 
1047 aa  102  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 
824 aa  101  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  30.38 
 
 
1047 aa  101  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  35.19 
 
 
1022 aa  101  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  30.38 
 
 
1048 aa  101  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  30.42 
 
 
904 aa  101  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  24.06 
 
 
1033 aa  101  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  25.49 
 
 
1247 aa  101  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  39.39 
 
 
1101 aa  101  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  29.04 
 
 
1009 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  26.4 
 
 
1238 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  32.34 
 
 
1046 aa  101  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  25 
 
 
1223 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  35.08 
 
 
1006 aa  99.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.15 
 
 
1020 aa  99.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  30.4 
 
 
1224 aa  98.6  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  32.45 
 
 
995 aa  98.2  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  32.32 
 
 
815 aa  97.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  33.01 
 
 
1017 aa  97.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  34.27 
 
 
851 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  31.03 
 
 
1059 aa  96.7  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  28.18 
 
 
1019 aa  97.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  35.98 
 
 
1214 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  33.86 
 
 
1265 aa  95.1  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  31.5 
 
 
1211 aa  94.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  30.72 
 
 
1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>