196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0704 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  63.82 
 
 		 1085 aa  1369    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  100 
 
 		 1091 aa  2207    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  69.76 
 
 		 1088 aa  1500    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  79.65 
 
 		 1091 aa  1753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  40.55 
 
 		 1230 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  39.17 
 
 		 1226 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  39.9 
 
 		 1223 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  43.91 
 
 		 1227 aa  400  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  47.6 
 
 		 1223 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  40.13 
 
 		 1224 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  42.48 
 
 		 1219 aa  355  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  42.72 
 
 		 1346 aa  319  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  43.29 
 
 		 1303 aa  316  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  42.65 
 
 		 1307 aa  315  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  35.23 
 
 		 1047 aa  290  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  35.23 
 
 		 1047 aa  290  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  35.23 
 
 		 1048 aa  289  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1048 aa  289  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  35.97 
 
 		 1047 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  35.08 
 
 		 1165 aa  278  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  50.78 
 
 		 1047 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  50.78 
 
 		 1047 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  50.78 
 
 		 1047 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  50.97 
 
 		 1046 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  50.97 
 
 		 1046 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  50.97 
 
 		 1046 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  50.97 
 
 		 1046 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  50.97 
 
 		 1046 aa  271  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  32.1 
 
 		 1227 aa  262  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  47.95 
 
 		 1042 aa  257  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  32.01 
 
 		 1227 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  45.87 
 
 		 1164 aa  253  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  51.26 
 
 		 1144 aa  253  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  48.11 
 
 		 1232 aa  252  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  48.8 
 
 		 1220 aa  251  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  48.8 
 
 		 1229 aa  251  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  52.52 
 
 		 1137 aa  251  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  48.8 
 
 		 1229 aa  251  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  36.1 
 
 		 1265 aa  251  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  48.41 
 
 		 1308 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  52.49 
 
 		 1226 aa  247  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  42.57 
 
 		 1227 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  53 
 
 		 1155 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  51.58 
 
 		 1227 aa  243  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  50.47 
 
 		 1238 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  39.17 
 
 		 1232 aa  238  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.89 
 
 		 1234 aa  237  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  43.81 
 
 		 1247 aa  237  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  31.34 
 
 		 1213 aa  217  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  25.04 
 
 		 1039 aa  198  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  29.69 
 
 		 1214 aa  194  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  39.58 
 
 		 1244 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  41.18 
 
 		 1214 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  28.71 
 
 		 1211 aa  179  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.83 
 
 		 1108 aa  178  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  40 
 
 		 1214 aa  178  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  25.24 
 
 		 1049 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  39.42 
 
 		 1214 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  38.59 
 
 		 1214 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  48.39 
 
 		 1101 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  37.1 
 
 		 1048 aa  172  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  38.17 
 
 		 1214 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  37.46 
 
 		 1248 aa  170  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  41.08 
 
 		 1211 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  40.15 
 
 		 1248 aa  169  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  39.02 
 
 		 1083 aa  167  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  24.44 
 
 		 1018 aa  165  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  24.66 
 
 		 1018 aa  158  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  53.12 
 
 		 1280 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  38.64 
 
 		 1245 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  42.71 
 
 		 1182 aa  145  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  39.3 
 
 		 1248 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  39.58 
 
 		 1245 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  28.52 
 
 		 1020 aa  134  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  43.32 
 
 		 1247 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  25.04 
 
 		 1018 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.71 
 
 		 1030 aa  116  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  35.86 
 
 		 1009 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  31.99 
 
 		 953 aa  112  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  49.62 
 
 		 1013 aa  112  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  44.76 
 
 		 1025 aa  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  28.86 
 
 		 1018 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  40 
 
 		 1020 aa  109  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  35.07 
 
 		 1009 aa  108  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  35.07 
 
 		 1009 aa  108  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  44.27 
 
 		 1018 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  38.1 
 
 		 910 aa  105  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  41.61 
 
 		 1018 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  41.61 
 
 		 1018 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  41.61 
 
 		 1018 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  41.61 
 
 		 1018 aa  105  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  42.34 
 
 		 1018 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 1029 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  40.82 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  40.82 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  40.82 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  41.61 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  40.82 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  40.82 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  40.82 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>