More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0772 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  100 
 
 		 961 aa  1856    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.86 
 
 		 906 aa  261  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  25.18 
 
 		 904 aa  218  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 		 1029 aa  210  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  25.35 
 
 		 1029 aa  201  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.03 
 
 		 1029 aa  201  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.61 
 
 		 1029 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  26.16 
 
 		 1029 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  25.35 
 
 		 1029 aa  190  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  24.5 
 
 		 1018 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  26.58 
 
 		 1049 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.25 
 
 		 1009 aa  170  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  25.07 
 
 		 1033 aa  169  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  23.23 
 
 		 1019 aa  168  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  27.89 
 
 		 1039 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  24.75 
 
 		 1018 aa  164  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  24.81 
 
 		 1018 aa  164  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  26.24 
 
 		 1108 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  21.88 
 
 		 1008 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  32.39 
 
 		 910 aa  149  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  25.64 
 
 		 1038 aa  144  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  25.16 
 
 		 1018 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  23.87 
 
 		 1018 aa  138  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  24.39 
 
 		 1047 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  24.39 
 
 		 1047 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  24.39 
 
 		 1047 aa  135  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  24.65 
 
 		 1047 aa  134  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  24.58 
 
 		 1047 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  23.56 
 
 		 1047 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 852 aa  125  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  25.71 
 
 		 852 aa  122  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  36.31 
 
 		 810 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  32.52 
 
 		 1103 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  33.94 
 
 		 1165 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  32.02 
 
 		 1099 aa  118  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25 
 
 		 1059 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.35 
 
 		 1114 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  32.49 
 
 		 815 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  28.13 
 
 		 857 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  26.12 
 
 		 824 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.65 
 
 		 1180 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.87 
 
 		 858 aa  109  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  33.33 
 
 		 1029 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  33.33 
 
 		 1029 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  32.84 
 
 		 1172 aa  109  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  33.33 
 
 		 1029 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  33.33 
 
 		 1029 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  33.33 
 
 		 1029 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  26.18 
 
 		 1116 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  31.87 
 
 		 851 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  36.71 
 
 		 1046 aa  105  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  23.75 
 
 		 1013 aa  105  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 		 824 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  32.8 
 
 		 1003 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  31.44 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  35.59 
 
 		 1006 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  30.62 
 
 		 1016 aa  101  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  26.58 
 
 		 993 aa  101  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  25.14 
 
 		 1007 aa  99.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  23.19 
 
 		 1018 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  23.02 
 
 		 1018 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 		 993 aa  98.6  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  23.02 
 
 		 1018 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  23.02 
 
 		 1018 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  21.27 
 
 		 1101 aa  98.2  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  23.19 
 
 		 1018 aa  98.2  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  23.35 
 
 		 1018 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  22.56 
 
 		 1018 aa  97.8  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  30.29 
 
 		 1307 aa  97.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  33.97 
 
 		 881 aa  97.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  28.34 
 
 		 1085 aa  96.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  27.37 
 
 		 1226 aa  96.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  30.92 
 
 		 1303 aa  96.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  32.54 
 
 		 1009 aa  95.5  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  32.54 
 
 		 1009 aa  95.5  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.44 
 
 		 859 aa  95.1  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1018 aa  94.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  24.93 
 
 		 1214 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  31.55 
 
 		 1346 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  31.32 
 
 		 1020 aa  94  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  38.97 
 
 		 1219 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  28.46 
 
 		 1227 aa  93.2  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  35.33 
 
 		 1249 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  32.46 
 
 		 1023 aa  93.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  26.78 
 
 		 1023 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  27.24 
 
 		 1214 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  30.67 
 
 		 1020 aa  92.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  24.37 
 
 		 1211 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  25.4 
 
 		 1031 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  34.59 
 
 		 1214 aa  92  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  37.68 
 
 		 1211 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  23.02 
 
 		 1214 aa  91.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  28.44 
 
 		 1229 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.36 
 
 		 1030 aa  90.5  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  31.64 
 
 		 1308 aa  90.9  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  24.02 
 
 		 1048 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  27.33 
 
 		 1223 aa  90.1  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  28.44 
 
 		 1229 aa  90.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1048 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  28.44 
 
 		 1220 aa  90.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>