244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  100 
 
 		 1108 aa  2193    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  35.85 
 
 		 1180 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  34.6 
 
 		 1172 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  34.04 
 
 		 1172 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  32.05 
 
 		 1165 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.51 
 
 		 1114 aa  443  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  25.82 
 
 		 1032 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  34.04 
 
 		 1223 aa  225  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  44.27 
 
 		 1116 aa  218  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  26.76 
 
 		 1223 aa  209  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  24.83 
 
 		 1091 aa  197  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  23.42 
 
 		 1018 aa  196  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  26.15 
 
 		 1088 aa  191  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.61 
 
 		 1029 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  24.75 
 
 		 1029 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  23.01 
 
 		 1018 aa  183  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 		 1091 aa  181  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.65 
 
 		 1029 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 		 1029 aa  170  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  23.93 
 
 		 1085 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  25.15 
 
 		 1029 aa  166  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.23 
 
 		 1029 aa  166  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  25.15 
 
 		 1029 aa  166  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  25.15 
 
 		 1029 aa  164  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25.06 
 
 		 1029 aa  163  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  22.69 
 
 		 1033 aa  161  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  21.4 
 
 		 1247 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  23.32 
 
 		 1244 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.53 
 
 		 906 aa  138  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.92 
 
 		 1029 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  38.42 
 
 		 910 aa  132  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.78 
 
 		 1030 aa  131  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  30.19 
 
 		 961 aa  129  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  22.64 
 
 		 1059 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  23.5 
 
 		 1047 aa  122  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  25.49 
 
 		 1230 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  22.7 
 
 		 1048 aa  121  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1048 aa  121  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  22.97 
 
 		 1047 aa  121  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  22.97 
 
 		 1047 aa  121  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.81 
 
 		 1039 aa  120  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  22.48 
 
 		 1047 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  25.92 
 
 		 1219 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  23.41 
 
 		 1265 aa  118  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  25.58 
 
 		 1049 aa  118  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  22.52 
 
 		 1048 aa  118  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  22.54 
 
 		 1047 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  22.81 
 
 		 1047 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  33.16 
 
 		 1227 aa  115  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  22.36 
 
 		 995 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  25.85 
 
 		 1182 aa  111  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  29.58 
 
 		 824 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  26.87 
 
 		 1009 aa  109  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  26.22 
 
 		 1307 aa  109  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  33.16 
 
 		 1229 aa  109  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  33.16 
 
 		 1229 aa  109  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  33.16 
 
 		 1083 aa  109  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  23.29 
 
 		 1018 aa  109  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  33.16 
 
 		 1220 aa  109  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.35 
 
 		 904 aa  109  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  23.29 
 
 		 1018 aa  109  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  25.53 
 
 		 1303 aa  108  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  30.8 
 
 		 881 aa  108  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  24.58 
 
 		 1227 aa  107  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  29.15 
 
 		 1011 aa  107  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  35.64 
 
 		 851 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  22.95 
 
 		 1018 aa  106  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  36.31 
 
 		 1227 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  22.9 
 
 		 1224 aa  105  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 824 aa  104  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  25.5 
 
 		 1046 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  30.34 
 
 		 1017 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  31.6 
 
 		 1223 aa  103  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  20.92 
 
 		 989 aa  103  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  25.78 
 
 		 1020 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  40.45 
 
 		 986 aa  103  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  37.02 
 
 		 1144 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  25.26 
 
 		 1038 aa  102  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  30.58 
 
 		 1164 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33.5 
 
 		 1018 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  25.21 
 
 		 1046 aa  102  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  25.21 
 
 		 1046 aa  102  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  35.71 
 
 		 1346 aa  102  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  30.48 
 
 		 1291 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  25.21 
 
 		 1046 aa  102  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  39.72 
 
 		 1234 aa  101  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.63 
 
 		 810 aa  101  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  25.21 
 
 		 1046 aa  101  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  38.89 
 
 		 1025 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  38.07 
 
 		 1013 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  31.01 
 
 		 1211 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  27.05 
 
 		 953 aa  99.8  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  34.24 
 
 		 1018 aa  99.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  30.61 
 
 		 1137 aa  99  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  35.79 
 
 		 1101 aa  99  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  29.95 
 
 		 1103 aa  99  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  34.3 
 
 		 1099 aa  98.6  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  37.71 
 
 		 986 aa  97.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  31.08 
 
 		 1009 aa  97.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  31.08 
 
 		 1009 aa  97.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>