204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3304 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  79.54 
 
 		 1227 aa  1765    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  40.73 
 
 		 1137 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  40.72 
 
 		 1265 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  40.03 
 
 		 1226 aa  681    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  50.12 
 
 		 1227 aa  1006    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1227 aa  2434    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  40.78 
 
 		 1232 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  50.32 
 
 		 1229 aa  915    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  38.51 
 
 		 1238 aa  651    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  49.19 
 
 		 1227 aa  945    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  50.16 
 
 		 1229 aa  913    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  50.24 
 
 		 1220 aa  911    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  41.22 
 
 		 1165 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  36.1 
 
 		 1247 aa  532  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  47.54 
 
 		 1083 aa  525  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  32.5 
 
 		 1230 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  29.06 
 
 		 1219 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  30.37 
 
 		 1224 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  64.01 
 
 		 1046 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  64.01 
 
 		 1046 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  64.01 
 
 		 1046 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  61.65 
 
 		 1048 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  64.01 
 
 		 1046 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  61.65 
 
 		 1048 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  61.36 
 
 		 1047 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  63.69 
 
 		 1046 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  61.65 
 
 		 1047 aa  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  61.65 
 
 		 1047 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  61.65 
 
 		 1047 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  61.98 
 
 		 1047 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  61.65 
 
 		 1047 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  61.7 
 
 		 1048 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  39.29 
 
 		 1232 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  62.88 
 
 		 1042 aa  357  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  59.73 
 
 		 1144 aa  355  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  30.19 
 
 		 1244 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  31.16 
 
 		 1182 aa  330  8e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  55.15 
 
 		 1164 aa  319  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  36.74 
 
 		 1346 aa  301  7e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  36.71 
 
 		 1155 aa  300  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  32.25 
 
 		 1088 aa  279  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  32.43 
 
 		 1091 aa  275  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  31.49 
 
 		 1226 aa  272  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  33.43 
 
 		 1227 aa  263  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  51.57 
 
 		 1308 aa  262  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  30.58 
 
 		 1223 aa  259  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  34.57 
 
 		 1303 aa  258  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  44.24 
 
 		 1234 aa  255  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  34.53 
 
 		 1307 aa  251  4e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  51.3 
 
 		 1223 aa  248  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  33.4 
 
 		 1091 aa  247  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  30.81 
 
 		 1085 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  46.55 
 
 		 1211 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  45.26 
 
 		 1211 aa  201  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 1214 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  45.6 
 
 		 1213 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  51.39 
 
 		 1214 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  45.6 
 
 		 1214 aa  186  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  50.93 
 
 		 1214 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  45.24 
 
 		 1214 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 1214 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  46.32 
 
 		 1101 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  34.3 
 
 		 1248 aa  165  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  49.54 
 
 		 1248 aa  163  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  35.05 
 
 		 1248 aa  160  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  36.26 
 
 		 1280 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  41.42 
 
 		 1245 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  31.41 
 
 		 1018 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  40.76 
 
 		 1245 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  30.38 
 
 		 1018 aa  125  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  33.33 
 
 		 1247 aa  125  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  31.07 
 
 		 1029 aa  124  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  34.62 
 
 		 1013 aa  124  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  30.56 
 
 		 1029 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  31.6 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  35.02 
 
 		 906 aa  122  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  39.25 
 
 		 953 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.58 
 
 		 1108 aa  121  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  31.29 
 
 		 1029 aa  121  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  30.98 
 
 		 1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  30.98 
 
 		 1029 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  30.98 
 
 		 1029 aa  119  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  30.98 
 
 		 1029 aa  118  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  46.43 
 
 		 881 aa  118  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.02 
 
 		 1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.82 
 
 		 1018 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  30.37 
 
 		 1029 aa  116  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  30.37 
 
 		 1029 aa  116  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  47.15 
 
 		 910 aa  115  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  44.85 
 
 		 1009 aa  114  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  39.18 
 
 		 1020 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  44.2 
 
 		 995 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32.99 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.99 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  39.9 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32.99 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  43.83 
 
 		 1249 aa  110  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  26.55 
 
 		 1039 aa  109  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  47.97 
 
 		 1025 aa  109  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32.44 
 
 		 1018 aa  109  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>