276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6131 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  100 
 
 		 851 aa  1605    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  39.56 
 
 		 906 aa  122  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  37.31 
 
 		 824 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  36.6 
 
 		 824 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  24.69 
 
 		 1039 aa  112  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  34.39 
 
 		 810 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  28.16 
 
 		 1108 aa  109  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  32.3 
 
 		 1017 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  31.87 
 
 		 961 aa  106  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  31.7 
 
 		 1180 aa  105  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.56 
 
 		 1230 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  34.02 
 
 		 1172 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  34.02 
 
 		 1172 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  42.31 
 
 		 904 aa  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  33.51 
 
 		 815 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  35.87 
 
 		 1223 aa  103  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  27.59 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  32.26 
 
 		 1099 aa  101  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  33 
 
 		 1018 aa  101  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  22.79 
 
 		 859 aa  101  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  40.12 
 
 		 910 aa  100  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  31.11 
 
 		 1018 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  31.11 
 
 		 1018 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.02 
 
 		 1020 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  34.78 
 
 		 1032 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  29.86 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  29.86 
 
 		 1018 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  35.39 
 
 		 1114 aa  99.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  38.22 
 
 		 953 aa  99  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  40.43 
 
 		 1226 aa  99.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  35.29 
 
 		 1009 aa  98.2  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  48.25 
 
 		 1013 aa  98.2  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  33.66 
 
 		 1103 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  28.74 
 
 		 1303 aa  98.2  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 1091 aa  97.8  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  31.72 
 
 		 1020 aa  97.8  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 1018 aa  97.4  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  33.86 
 
 		 1020 aa  97.4  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  32.5 
 
 		 1018 aa  97.4  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  34.27 
 
 		 1116 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  46.67 
 
 		 1091 aa  97.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  29.41 
 
 		 1018 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  46.22 
 
 		 1223 aa  97.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  28.62 
 
 		 1018 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  31.38 
 
 		 1019 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 1029 aa  96.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  39.84 
 
 		 1307 aa  96.3  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  36.17 
 
 		 1025 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  30.27 
 
 		 1029 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  44.63 
 
 		 1085 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  27.47 
 
 		 1029 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  53.12 
 
 		 1234 aa  95.5  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  27.13 
 
 		 1029 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  36.4 
 
 		 1137 aa  94.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  41.73 
 
 		 1088 aa  94.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.83 
 
 		 1029 aa  94.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.83 
 
 		 1029 aa  94.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.09 
 
 		 1029 aa  94.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.83 
 
 		 1029 aa  94.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.83 
 
 		 1029 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  45.58 
 
 		 1101 aa  94.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.67 
 
 		 1029 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.16 
 
 		 1029 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  34.74 
 
 		 1023 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  42.04 
 
 		 1049 aa  94  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  31.77 
 
 		 1018 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  31.64 
 
 		 1165 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  32.16 
 
 		 1081 aa  93.2  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  31.98 
 
 		 1029 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  41.48 
 
 		 1224 aa  93.2  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  40.71 
 
 		 1009 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  29.47 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  40.71 
 
 		 1009 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  29.86 
 
 		 1018 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  36.31 
 
 		 1346 aa  92.4  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  41.74 
 
 		 1046 aa  92.4  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  51.11 
 
 		 1223 aa  92.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  48.96 
 
 		 1018 aa  92  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  47.32 
 
 		 1213 aa  92  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  48.96 
 
 		 1018 aa  91.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  41.98 
 
 		 1219 aa  91.3  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  33.82 
 
 		 1227 aa  91.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  48.96 
 
 		 1018 aa  90.9  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  38.41 
 
 		 881 aa  90.9  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  33.15 
 
 		 1009 aa  90.1  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  31.34 
 
 		 1227 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  45.45 
 
 		 1059 aa  89.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  46.43 
 
 		 1214 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  46.43 
 
 		 1214 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  46.43 
 
 		 1214 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  46.43 
 
 		 1214 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  44.12 
 
 		 1022 aa  88.6  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  32.06 
 
 		 1227 aa  88.6  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  30.81 
 
 		 1011 aa  88.2  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  40 
 
 		 1211 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  45.61 
 
 		 1214 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  40 
 
 		 1211 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  28.7 
 
 		 1047 aa  87.8  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  30.89 
 
 		 1042 aa  87.4  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.38 
 
 		 924 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>