More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4031 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 810 aa  1606    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  44.54 
 
 		 824 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  45.26 
 
 		 824 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  39.95 
 
 		 815 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.75 
 
 		 906 aa  224  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  50.52 
 
 		 1103 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  38.46 
 
 		 1099 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  34.85 
 
 		 910 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  39.81 
 
 		 1046 aa  125  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  36.31 
 
 		 961 aa  122  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  32.69 
 
 		 904 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  30.53 
 
 		 1180 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  30.94 
 
 		 1182 aa  117  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  38.78 
 
 		 1223 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  35.78 
 
 		 1018 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.05 
 
 		 1018 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  35.79 
 
 		 1025 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  26.58 
 
 		 1219 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  36.68 
 
 		 1006 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  30.43 
 
 		 1308 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  36.41 
 
 		 1172 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.66 
 
 		 1030 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  33.47 
 
 		 1155 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  27.92 
 
 		 1018 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  31.15 
 
 		 1232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  29.78 
 
 		 1223 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  35.9 
 
 		 1172 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  27.92 
 
 		 1018 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  34.33 
 
 		 1018 aa  111  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  34.83 
 
 		 1018 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  28.48 
 
 		 1116 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 1022 aa  110  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  34.83 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  32.47 
 
 		 1227 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  34.38 
 
 		 851 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  30.4 
 
 		 1244 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  27.55 
 
 		 1114 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  35.32 
 
 		 1291 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  33.83 
 
 		 1018 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  27.52 
 
 		 1018 aa  109  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  34.8 
 
 		 1018 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  34.02 
 
 		 1165 aa  109  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  35.12 
 
 		 1020 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  34.33 
 
 		 1018 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  34.33 
 
 		 1018 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  35.32 
 
 		 1018 aa  108  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  30.22 
 
 		 1230 aa  108  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  34.48 
 
 		 1018 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  32.11 
 
 		 1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  29.24 
 
 		 1091 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  35.92 
 
 		 1013 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  28.88 
 
 		 1088 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  30.98 
 
 		 1234 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  26.67 
 
 		 1108 aa  105  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  34.01 
 
 		 1226 aa  105  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  28.4 
 
 		 1046 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  28.44 
 
 		 1211 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 1247 aa  104  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  30.59 
 
 		 1213 aa  104  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  34.63 
 
 		 989 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  28.4 
 
 		 1046 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  32.51 
 
 		 1018 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  30.84 
 
 		 1238 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  31.11 
 
 		 1085 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  28.4 
 
 		 1046 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  35 
 
 		 1265 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  28.4 
 
 		 1046 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  28.4 
 
 		 1046 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  29.58 
 
 		 1048 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1048 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  29.43 
 
 		 1047 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  29.58 
 
 		 1047 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  29.58 
 
 		 1047 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  29.43 
 
 		 1047 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  34.48 
 
 		 1232 aa  103  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  26.61 
 
 		 1226 aa  103  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.51 
 
 		 1039 aa  103  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.67 
 
 		 1020 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  27.86 
 
 		 1214 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  25.62 
 
 		 1029 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  29.41 
 
 		 1303 aa  102  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  29.71 
 
 		 1224 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  37.56 
 
 		 986 aa  102  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  29.23 
 
 		 1047 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  29.11 
 
 		 1307 aa  101  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  35.82 
 
 		 1020 aa  102  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  34.01 
 
 		 1009 aa  102  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  34.52 
 
 		 1047 aa  101  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  30.59 
 
 		 1346 aa  101  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  32.84 
 
 		 1023 aa  101  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  28.94 
 
 		 1227 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  29.23 
 
 		 1047 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  32.22 
 
 		 1165 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  45.45 
 
 		 1009 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  26.3 
 
 		 1214 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  33.02 
 
 		 995 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  31.15 
 
 		 1211 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  28.51 
 
 		 1227 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  29.57 
 
 		 1227 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  30.29 
 
 		 1214 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>