214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0760 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  100 
 
 
1165 aa  2329    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  42.18 
 
 
1172 aa  770    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  42.01 
 
 
1172 aa  767    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  34.66 
 
 
1180 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  32.05 
 
 
1108 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  42.43 
 
 
1114 aa  213  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  44.53 
 
 
1116 aa  190  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  51.83 
 
 
1223 aa  158  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  34.48 
 
 
1032 aa  144  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  25.91 
 
 
1018 aa  136  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30.79 
 
 
1018 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  32.64 
 
 
1029 aa  132  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  29.27 
 
 
904 aa  124  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  35.98 
 
 
1039 aa  123  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  33.94 
 
 
961 aa  122  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  31.39 
 
 
1018 aa  121  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.51 
 
 
906 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  31.11 
 
 
1018 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  32.17 
 
 
910 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  32.49 
 
 
1013 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  37.37 
 
 
1018 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  37.37 
 
 
1018 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  29.97 
 
 
1018 aa  116  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  37.37 
 
 
1018 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  37.37 
 
 
1018 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  32.52 
 
 
995 aa  115  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  33.2 
 
 
1265 aa  115  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  30.11 
 
 
1018 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  37.38 
 
 
1018 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.77 
 
 
1030 aa  114  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  37.43 
 
 
1291 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  36.17 
 
 
1018 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 
1029 aa  112  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  35.29 
 
 
1006 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  36.62 
 
 
1103 aa  111  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  34.21 
 
 
1018 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  33.59 
 
 
1020 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  35.45 
 
 
1025 aa  110  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  35.47 
 
 
1022 aa  109  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  27.61 
 
 
1308 aa  108  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  34.02 
 
 
810 aa  108  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  31.64 
 
 
1214 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  32.74 
 
 
1099 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  33.51 
 
 
1020 aa  104  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  29.03 
 
 
1024 aa  104  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  34.18 
 
 
824 aa  104  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  34.41 
 
 
1226 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  32.54 
 
 
1091 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  31.89 
 
 
1020 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  32.24 
 
 
1011 aa  103  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  25.38 
 
 
1046 aa  102  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  32.8 
 
 
962 aa  102  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  30.82 
 
 
1018 aa  102  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  34.33 
 
 
1046 aa  102  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  35.23 
 
 
1083 aa  101  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 
1214 aa  101  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  29.96 
 
 
1059 aa  101  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  30.23 
 
 
1214 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  30.86 
 
 
1214 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  31.95 
 
 
1018 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  26.71 
 
 
1219 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  31.98 
 
 
1017 aa  101  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  31.54 
 
 
1088 aa  100  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 
1214 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  38.46 
 
 
881 aa  99.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  26.34 
 
 
1182 aa  99  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  31.75 
 
 
953 aa  99  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 
1214 aa  98.6  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  27.57 
 
 
1029 aa  98.6  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  31.1 
 
 
1091 aa  98.2  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  28.75 
 
 
1137 aa  98.2  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  29.74 
 
 
1165 aa  97.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  29.03 
 
 
1046 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  28.99 
 
 
1244 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  33.06 
 
 
1346 aa  96.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  36.55 
 
 
1247 aa  96.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.96 
 
 
1234 aa  96.3  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  31.91 
 
 
1164 aa  96.3  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  38.82 
 
 
1009 aa  95.9  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  29.33 
 
 
1029 aa  95.9  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  29.57 
 
 
1047 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  29.57 
 
 
1047 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  29.57 
 
 
1047 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  29.57 
 
 
1048 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  29.57 
 
 
1048 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  29.57 
 
 
1048 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  32.09 
 
 
1023 aa  95.5  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  29.57 
 
 
1047 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  29.57 
 
 
1047 aa  95.5  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  35.83 
 
 
1307 aa  95.1  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  32.43 
 
 
1029 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  29.57 
 
 
1047 aa  95.5  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  28.65 
 
 
989 aa  95.1  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  32.43 
 
 
1029 aa  95.1  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  35.83 
 
 
1303 aa  94.7  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  34.01 
 
 
824 aa  94.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.33 
 
 
1029 aa  94.7  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.25 
 
 
1029 aa  94.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  31.22 
 
 
986 aa  94  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  28.49 
 
 
1046 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>