186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1149 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  100 
 
 		 1101 aa  2119    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  29.79 
 
 		 1088 aa  344  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  38.27 
 
 		 1211 aa  341  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  30.02 
 
 		 1091 aa  339  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  50.51 
 
 		 1214 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  48.73 
 
 		 1214 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  50.77 
 
 		 1214 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  55.21 
 
 		 1214 aa  331  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  47.46 
 
 		 1214 aa  330  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  38.2 
 
 		 1211 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  51.04 
 
 		 1213 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  48.96 
 
 		 1214 aa  320  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  39.63 
 
 		 1244 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  48.51 
 
 		 1280 aa  217  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  41.57 
 
 		 1182 aa  209  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  51.79 
 
 		 1248 aa  204  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  51.79 
 
 		 1248 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  50.22 
 
 		 1248 aa  202  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  45.33 
 
 		 1232 aa  196  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  42.52 
 
 		 1144 aa  192  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  39.87 
 
 		 1247 aa  191  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  43.05 
 
 		 1226 aa  190  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  44.78 
 
 		 1155 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  44.8 
 
 		 1232 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  36.36 
 
 		 1265 aa  185  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  44.81 
 
 		 1238 aa  185  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.29 
 
 		 1219 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  44.39 
 
 		 1229 aa  181  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  46.21 
 
 		 1245 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  44.39 
 
 		 1220 aa  181  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  44.39 
 
 		 1229 aa  180  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  46.62 
 
 		 1247 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  45.15 
 
 		 1137 aa  179  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  28.02 
 
 		 1091 aa  178  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  43.81 
 
 		 1085 aa  177  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  43.05 
 
 		 1227 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  46.55 
 
 		 1245 aa  176  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  41.42 
 
 		 1227 aa  174  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.61 
 
 		 1018 aa  174  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  40.42 
 
 		 1227 aa  173  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  39.38 
 
 		 1227 aa  172  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  34.24 
 
 		 1234 aa  171  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  34.87 
 
 		 1307 aa  169  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  40.09 
 
 		 1303 aa  167  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  41.63 
 
 		 1046 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  46.24 
 
 		 1226 aa  167  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  39.03 
 
 		 1308 aa  166  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  164  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  164  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  39.11 
 
 		 1227 aa  163  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  24.02 
 
 		 1029 aa  162  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  38.29 
 
 		 1224 aa  161  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  42.61 
 
 		 1223 aa  160  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  49.43 
 
 		 1230 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  44.39 
 
 		 1346 aa  160  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  48.82 
 
 		 1223 aa  159  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.15 
 
 		 1029 aa  157  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  43.06 
 
 		 1083 aa  141  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  49.7 
 
 		 1048 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  49.7 
 
 		 1048 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  49.7 
 
 		 1047 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  49.7 
 
 		 1047 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  49.7 
 
 		 1048 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  49.7 
 
 		 1047 aa  135  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  49.7 
 
 		 1047 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  49.4 
 
 		 1047 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  49.7 
 
 		 1047 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  49.69 
 
 		 1042 aa  134  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.61 
 
 		 1029 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  48.13 
 
 		 1164 aa  130  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  46.84 
 
 		 1046 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  26.34 
 
 		 1029 aa  125  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  47.64 
 
 		 1165 aa  123  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  31.1 
 
 		 1009 aa  117  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  33.33 
 
 		 1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  45.78 
 
 		 881 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  43.75 
 
 		 1029 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  33.33 
 
 		 1029 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  40.49 
 
 		 1009 aa  113  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  40.49 
 
 		 1009 aa  113  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  43.12 
 
 		 1029 aa  112  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  43.12 
 
 		 1029 aa  112  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  41.8 
 
 		 1020 aa  111  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  50.35 
 
 		 1025 aa  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  29.19 
 
 		 1013 aa  107  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  39.78 
 
 		 1046 aa  106  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  39.66 
 
 		 1018 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  43.01 
 
 		 1020 aa  104  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  40.11 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  36.52 
 
 		 1081 aa  103  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  41.67 
 
 		 1030 aa  102  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 1018 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  38.89 
 
 		 1018 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  37.93 
 
 		 1018 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 1018 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  44.2 
 
 		 1017 aa  102  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  38.92 
 
 		 1020 aa  102  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 1018 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.41 
 
 		 1038 aa  102  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>