228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05654 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  72.98 
 
 		 1018 aa  1484    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  41.84 
 
 		 1013 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  100 
 
 		 1018 aa  2056    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  39.32 
 
 		 1020 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  39.54 
 
 		 1018 aa  595  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  39.66 
 
 		 1018 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  39.75 
 
 		 1018 aa  581  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  39.77 
 
 		 1018 aa  569  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  39.66 
 
 		 1018 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  38.65 
 
 		 1018 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  38.92 
 
 		 1018 aa  548  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  37.36 
 
 		 1018 aa  545  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  39.01 
 
 		 1018 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  38.51 
 
 		 1018 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.86 
 
 		 1020 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  30.83 
 
 		 1049 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  30.32 
 
 		 1029 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  30 
 
 		 1039 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  29.9 
 
 		 1029 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  28.97 
 
 		 1029 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.75 
 
 		 1029 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.24 
 
 		 1029 aa  373  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  29.19 
 
 		 1029 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.13 
 
 		 1029 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.8 
 
 		 1029 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  29.04 
 
 		 1029 aa  366  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  29.04 
 
 		 1029 aa  366  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.66 
 
 		 1029 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  27.36 
 
 		 1024 aa  317  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.9 
 
 		 1038 aa  317  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  40.97 
 
 		 1018 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  40.97 
 
 		 1018 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  40.97 
 
 		 1018 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  26.82 
 
 		 1009 aa  290  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  26.82 
 
 		 1009 aa  290  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  26.7 
 
 		 1009 aa  286  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  28.52 
 
 		 989 aa  274  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.74 
 
 		 1059 aa  270  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  25.82 
 
 		 1046 aa  267  5.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  27.22 
 
 		 1011 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  34.38 
 
 		 1020 aa  243  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  27.02 
 
 		 1116 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.3 
 
 		 1030 aa  205  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  28.84 
 
 		 1033 aa  198  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  51.08 
 
 		 953 aa  189  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.31 
 
 		 1114 aa  188  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  56.45 
 
 		 1017 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.97 
 
 		 1108 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  41.31 
 
 		 881 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  47.64 
 
 		 1081 aa  179  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  24.66 
 
 		 1091 aa  173  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.94 
 
 		 906 aa  172  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  25.06 
 
 		 1137 aa  171  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  40.7 
 
 		 1025 aa  162  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  38.78 
 
 		 1291 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  39.89 
 
 		 962 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  48.28 
 
 		 1006 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  36.11 
 
 		 995 aa  149  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.84 
 
 		 995 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  46.91 
 
 		 1022 aa  145  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  37.31 
 
 		 1046 aa  141  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  37.24 
 
 		 1249 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  29.58 
 
 		 1047 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  46.15 
 
 		 986 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  26.53 
 
 		 1091 aa  138  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  48.5 
 
 		 1023 aa  136  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  39.58 
 
 		 1191 aa  135  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  26.2 
 
 		 1085 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  26.94 
 
 		 1088 aa  132  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  33.22 
 
 		 1223 aa  131  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  37 
 
 		 986 aa  131  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  47.73 
 
 		 1058 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  27.55 
 
 		 1224 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  44.38 
 
 		 1009 aa  126  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  31.06 
 
 		 1223 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  24.02 
 
 		 1032 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  33.11 
 
 		 1230 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  33.15 
 
 		 1227 aa  119  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 1346 aa  119  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.01 
 
 		 1019 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  29.49 
 
 		 1211 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  30.95 
 
 		 1172 aa  116  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  23.5 
 
 		 1016 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  28.41 
 
 		 1211 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  31.55 
 
 		 1172 aa  115  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  32.32 
 
 		 1083 aa  114  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  32.41 
 
 		 1047 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  32.41 
 
 		 1047 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  32.41 
 
 		 1047 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  32.41 
 
 		 1047 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  29.41 
 
 		 1307 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.59 
 
 		 1219 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  29.41 
 
 		 1303 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  32.41 
 
 		 1047 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  31.82 
 
 		 1232 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  28.39 
 
 		 1042 aa  112  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  32.1 
 
 		 1047 aa  111  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  28.96 
 
 		 1227 aa  111  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  32.84 
 
 		 1155 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1048 aa  110  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>