220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0454 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  41.11 
 
 		 1018 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  100 
 
 		 1013 aa  2028    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  42.41 
 
 		 1018 aa  676    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  39.9 
 
 		 1018 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  40.46 
 
 		 1018 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  39.75 
 
 		 1018 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  40.19 
 
 		 1018 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  40.09 
 
 		 1018 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  39.75 
 
 		 1018 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  39.96 
 
 		 1018 aa  562  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  40.19 
 
 		 1018 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  39.73 
 
 		 1018 aa  559  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  38.19 
 
 		 1020 aa  555  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  40.19 
 
 		 1018 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.66 
 
 		 1020 aa  432  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  29.39 
 
 		 1029 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  30.06 
 
 		 1049 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.64 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  29.99 
 
 		 1029 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  29.53 
 
 		 1029 aa  383  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.32 
 
 		 1029 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  29.62 
 
 		 1039 aa  379  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  29.44 
 
 		 1029 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.69 
 
 		 1029 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  29.82 
 
 		 1029 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  29.44 
 
 		 1029 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  29.69 
 
 		 1029 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.44 
 
 		 1029 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.04 
 
 		 1038 aa  361  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  50.53 
 
 		 1018 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.31 
 
 		 1024 aa  297  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  49.87 
 
 		 1018 aa  295  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  50.42 
 
 		 1018 aa  290  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  27.95 
 
 		 1033 aa  285  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  25.4 
 
 		 1011 aa  257  8e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  50.43 
 
 		 1020 aa  238  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  44.41 
 
 		 1017 aa  204  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  26.34 
 
 		 1088 aa  195  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  27.97 
 
 		 953 aa  193  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  52.73 
 
 		 1025 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  51.18 
 
 		 1009 aa  169  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.91 
 
 		 881 aa  168  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  41.54 
 
 		 1081 aa  166  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  41.07 
 
 		 1009 aa  162  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  41.07 
 
 		 1009 aa  162  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.9 
 
 		 1059 aa  161  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.29 
 
 		 1291 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  41.97 
 
 		 962 aa  156  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  49.47 
 
 		 1006 aa  154  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  38.62 
 
 		 995 aa  151  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.7 
 
 		 1114 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  39.38 
 
 		 1023 aa  149  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  44.61 
 
 		 986 aa  148  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  35.59 
 
 		 1047 aa  148  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  50.29 
 
 		 986 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  39.49 
 
 		 1249 aa  144  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  27.74 
 
 		 1116 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  42.79 
 
 		 1009 aa  141  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  44.38 
 
 		 1046 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  43.45 
 
 		 1022 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  31.64 
 
 		 1085 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  47.56 
 
 		 989 aa  132  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  40.21 
 
 		 1191 aa  132  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  48.57 
 
 		 1058 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  46.47 
 
 		 995 aa  128  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  34.24 
 
 		 1230 aa  124  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  36.05 
 
 		 1046 aa  123  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  35.56 
 
 		 1223 aa  122  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  41.15 
 
 		 1346 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  32.62 
 
 		 1155 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  31.06 
 
 		 1211 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  32.49 
 
 		 1165 aa  118  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  37.34 
 
 		 1211 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  31.85 
 
 		 1226 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  30.59 
 
 		 1083 aa  117  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.43 
 
 		 1108 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  32.15 
 
 		 1224 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  42.51 
 
 		 1091 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  39.18 
 
 		 1213 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  41.24 
 
 		 1214 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  30.47 
 
 		 1303 aa  114  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  47.83 
 
 		 1307 aa  112  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  31.32 
 
 		 1046 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  31.32 
 
 		 1046 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  29.72 
 
 		 1047 aa  112  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  31.4 
 
 		 1046 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  29.72 
 
 		 1047 aa  112  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  29.72 
 
 		 1047 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  31.32 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  29.72 
 
 		 1047 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  31.32 
 
 		 1046 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  45.33 
 
 		 1214 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  45.33 
 
 		 1214 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  45.33 
 
 		 1214 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  32.17 
 
 		 1047 aa  111  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  30.52 
 
 		 1226 aa  110  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  40.33 
 
 		 1214 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  45.33 
 
 		 1214 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  41.98 
 
 		 1223 aa  110  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  30.87 
 
 		 1219 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>