210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1039 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  49.95 
 
 		 1048 aa  805    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  49.86 
 
 		 1048 aa  804    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  49.64 
 
 		 1047 aa  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  42.75 
 
 		 1155 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  55.1 
 
 		 1220 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  50.09 
 
 		 1047 aa  809    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  49.95 
 
 		 1048 aa  805    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  50.18 
 
 		 1047 aa  812    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  55.78 
 
 		 1229 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  50 
 
 		 1047 aa  812    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  55.51 
 
 		 1229 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  50.09 
 
 		 1047 aa  809    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  49.91 
 
 		 1047 aa  808    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1083 aa  2135    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  48.64 
 
 		 1227 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  46.09 
 
 		 1227 aa  542  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  47.5 
 
 		 1227 aa  525  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  45.65 
 
 		 1227 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  32.18 
 
 		 1088 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  68.03 
 
 		 1046 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  68.03 
 
 		 1046 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  68.03 
 
 		 1046 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  68.03 
 
 		 1046 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  46.99 
 
 		 1042 aa  399  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  44.62 
 
 		 1165 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  67.69 
 
 		 1046 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  51.6 
 
 		 1226 aa  352  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  52.48 
 
 		 1232 aa  349  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  52.14 
 
 		 1232 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  48.52 
 
 		 1247 aa  342  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  47.25 
 
 		 1308 aa  339  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  50 
 
 		 1265 aa  334  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  57.86 
 
 		 1164 aa  332  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  48.74 
 
 		 1238 aa  331  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  60.76 
 
 		 1144 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  57.06 
 
 		 1137 aa  307  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  45.83 
 
 		 1234 aa  298  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  38.58 
 
 		 1226 aa  269  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  33.93 
 
 		 1227 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  45.24 
 
 		 1223 aa  251  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  45.21 
 
 		 1230 aa  247  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  51.08 
 
 		 1346 aa  246  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  46.07 
 
 		 1223 aa  245  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  35.26 
 
 		 1219 aa  244  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  47.41 
 
 		 1224 aa  232  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  42.46 
 
 		 1303 aa  229  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  43.94 
 
 		 1307 aa  224  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  43.54 
 
 		 1244 aa  207  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  44.44 
 
 		 1211 aa  204  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  41.97 
 
 		 1214 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  46.18 
 
 		 1211 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  41.89 
 
 		 1214 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  24.22 
 
 		 1039 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  27.77 
 
 		 1018 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  39.02 
 
 		 1214 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  46.96 
 
 		 1213 aa  195  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  35.48 
 
 		 1091 aa  194  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  40.91 
 
 		 1214 aa  194  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  34.15 
 
 		 1085 aa  193  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  36.62 
 
 		 1091 aa  191  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  47.37 
 
 		 1214 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  47.97 
 
 		 1214 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  36.92 
 
 		 1280 aa  184  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  23.91 
 
 		 1049 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  36.5 
 
 		 1248 aa  179  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  25.48 
 
 		 1116 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  41.88 
 
 		 1248 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  46.32 
 
 		 1101 aa  163  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  38.31 
 
 		 1248 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  56.17 
 
 		 1182 aa  155  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  20.91 
 
 		 1009 aa  144  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  34.53 
 
 		 1018 aa  141  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  33.33 
 
 		 1018 aa  136  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  37.02 
 
 		 1245 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  50.61 
 
 		 1245 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  37.7 
 
 		 1247 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  33.24 
 
 		 1013 aa  127  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  46.43 
 
 		 881 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  30.74 
 
 		 1029 aa  119  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  31.06 
 
 		 1018 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8032  potential exonuclease  41.86 
 
 		 266 aa  118  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  27.73 
 
 		 1029 aa  118  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  33.94 
 
 		 953 aa  117  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.11 
 
 		 1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.98 
 
 		 1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  37.17 
 
 		 906 aa  117  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.11 
 
 		 1029 aa  116  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.11 
 
 		 1029 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  30.44 
 
 		 1018 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  30.44 
 
 		 1018 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  30.44 
 
 		 1018 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  27.81 
 
 		 1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  32.69 
 
 		 1020 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  27.81 
 
 		 1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  43.06 
 
 		 995 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  42.13 
 
 		 1249 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  48.78 
 
 		 1025 aa  114  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32.67 
 
 		 1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.77 
 
 		 1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  32.71 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>